RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 HEXDCQ8WVB3 486 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 PEX13Q92968 403 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TADA1Q96BN2 335 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 C19orf60Q96EN9 201 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ELMO2Q96JJ3 720 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 RDH12Q96NR8 316 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 OLFM1Q99784 485 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 SLC29A1Q99808 456 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 FICDQ9BVA6 458 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TRIM62Q9BVG3 475 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 OR2B2Q9GZK3 357 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TRPV6Q9H1D0 765 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CXCL16Q9H2A7 254 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 MFSD1Q9H3U5 465 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 POPDC3Q9HBV1 291 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CHRAC1Q9NRG0 131 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 SMOXQ9NWM0 555 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 GTSE1Q9NYZ3 720 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ADA2Q9NZK5 511 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 FBXO5Q9UKT4 447 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 SH3GLB1Q9Y371 365 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 NDUFAF1Q9Y375 327 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 PATJQ8NI35 1801 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CITO14578 2027 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 SCN1AP35498 2009 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 A0A0J9YYE9 177 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 NEMP2A6NFY4 417 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TMEM221A6NGB7 291 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 YJEFN3A6XGL0 299 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 H0YAE9 185 aa3.79□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 PTGESO14684 152 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ARPC2O15144 300 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 SLC7A4O43246 635 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 XRCC3O43542 346 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 PFDN1O60925 122 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 EEDO75530 441 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 BAIAP3O94812 1187 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 SUPT7LO94864 414 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 JCHAINP01591 159 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 HLA-DQB2P05538 268 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 PGK2P07205 417 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 FGF4P08620 206 aa3.79□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 ZNF286BP0CG31 522 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 THEGLP0DJG4 465 aa3.79□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 UMPSP11172 480 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 GFAPP14136 432 aa3.79□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 IMPDH1P20839 514 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 FASP25445 335 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 PSMA3P25788 255 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 HLA-FP30511 346 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CAPGP40121 348 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 GABARAPL2P60520 117 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ESRRGP62508 458 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 CYTH1Q15438 398 aa3.79□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 UGT3A2Q3SY77 523 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 PHLDA2Q53GA4 152 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 UNC50Q53HI1 259 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 XKR7Q5GH72 579 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.79□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 FRRS1Q6ZNA5 592 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CATSPER4Q7RTX7 472 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TAC4Q86UU9 113 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D21Q8IYX1 336 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CBR4Q8N4T8 237 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CCNYL1Q8N7R7 359 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TRPV3Q8NET8 790 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.79□□□□□ -1.8
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