RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
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SH3BP2-218ENST00000511185 OPN1LWP04000 364 aa16.85■□□□□ 0.29
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SH3BP2-218ENST00000511185 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.291e-13■■■■□ 22.1
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SH3BP2-218ENST00000511185 GSTA3Q16772 222 aa16.83■□□□□ 0.28
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SH3BP2-218ENST00000511185 ROPN1LQ96C74 230 aa16.83■□□□□ 0.28
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SH3BP2-218ENST00000511185 TM9SF2Q99805 663 aa16.83■□□□□ 0.28
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SH3BP2-218ENST00000511185 A0A087WZY1 265 aa16.82■□□□□ 0.28
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SH3BP2-218ENST00000511185 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 STX11O75558 287 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFSF13O75888 250 aa16.82■□□□□ 0.28
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SH3BP2-218ENST00000511185 TLE4Q04727 773 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 PON3Q15166 354 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF141Q15928 474 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SYPL1Q16563 259 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 VWA1Q6PCB0 445 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF621Q6ZSS3 439 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 MIER2Q8N344 545 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKFN1Q8N957 763 aa16.82■□□□□ 0.28
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