RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 CCT8L2Q96SF2 557 aa13.22□□□□□ -0.29
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SH3BP2-208ENST00000504294 SLC6A15Q9H2J7 730 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
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SH3BP2-208ENST00000504294 COPZ1P61923 177 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF117Q03924 483 aa13.19□□□□□ -0.3
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SH3BP2-208ENST00000504294 FUT5Q11128 374 aa13.19□□□□□ -0.3
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