RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ERP27	Q96DN0	273 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	MTBP	Q96DY7	904 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	VSTM2L	Q96N03	204 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	JMJD8	Q96S16	334 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX12	Q9UMY4	172 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX24	Q9Y343	169 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM159B	A6NKW6	160 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	COQ9	O75208	318 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	OPN1LW	P04000	364 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNGR1	P15260	489 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	IL11	P20809	199 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	PTN	P21246	168 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ME2	P23368	584 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH11	P55287	796 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	DSCR9	P59020	149 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	IRF9	Q00978	393 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	RUNX1T1	Q06455	604 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	BSPH1	Q075Z2	132 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TAB1	Q15750	504 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	STK11	Q15831	433 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	DECR1	Q16698	335 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	AGAP6	Q5VW22	663 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	LIPN	Q5VXI9	398 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	MARCH3	Q86UD3	253 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GGN	Q86UU5	652 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC25	Q86WR0	208 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD17B8	Q92506	261 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF21B	Q96EK2	531 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CHODL	Q9H9P2	273 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM160	Q9NX00	188 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	OR7A17	O14581	309 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFSF11	O14788	317 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	LMX1B	O60663	402 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	HNF1A	P20823	631 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	AGTR1	P30556	359 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	C21orf58	P58505	322 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	VLDLR	P98155	873 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CALCOCO2	Q13137	446 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ACAP2	Q15057	778 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB35	Q15286	201 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	PGGHG	Q32M88	737 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	HBM	Q6B0K9	141 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT10	Q86SR1	603 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	BANP	Q8N9N5	519 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	BVES	Q8NE79	360 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC9A6	Q92581	669 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF681	Q96N22	645 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	BBS4	Q96RK4	519 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511		Q9N2J8	555 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX6	Q9UNH7	406 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ANK2	Q01484	3957 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	9.62	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC189	A1A4V9	331 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	FADS1	O60427	444 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	NTN1	O95631	604 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ANGPTL1	O95841	491 aa		9.61	□□□□□ -0.87

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