RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	PINK1	Q9BXM7	581 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MED17	Q9NVC6	651 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CALML5	Q9NZT1	146 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	C7orf72	A4D263	438 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	C19orf84	I3L1E1	186 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SYT5	O00445	386 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CSTA	P01040	98 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	OR12D1	P0DN82	309 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	NR2F1	P10589	423 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	PGC	P20142	388 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ELK4	P28324	431 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC7A1	P30825	629 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNJ5	P48544	419 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	STK32C	Q86UX6	486 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF563	Q8TA94	476 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	PMM1	Q92871	262 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ROPN1L	Q96C74	230 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	NEURL3	Q96EH8	262 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	GLRX2	Q9NS18	164 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MRGBP	Q9NV56	204 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SERINC4	A6NH21	518 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD28	O15084	1053 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77	1e-6	■□□□□ 10.9
TTLL3-231	ENST00000496246	GUSB	P08236	651 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CPOX	P36551	454 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC6A8	P48029	635 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF136	P52737	540 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	WNT3	P56703	355 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN15	P56746	228 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SORD	Q00796	357 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	PON3	Q15166	354 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CDSN	Q15517	529 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	KLHL26	Q53HC5	615 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SAXO2	Q658L1	398 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	APOOL	Q6UXV4	268 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	LILRA2	Q8N149	483 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	OR5W2	Q8NH69	310 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM222B	Q8WU58	562 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEB18	Q96M61	343 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF145	Q96MT1	663 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MKLN1	Q9UL63	735 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	PROCR	Q9UNN8	238 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM234B	A2RU67	622 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	C5orf58	C9J3I9	102 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MSTN	O14793	375 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	GOSR1	O95249	250 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	NPIPA8	P0DM63	369 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	IL7R	P16871	459 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CRAT	P43155	626 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CARD18	P57730	90 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		10.22	□□□□□ -0.77

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