RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 MGLLQ99685 303 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 IFT22Q9H7X7 185 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TIGARQ9NQ88 270 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CNIH4Q9P003 139 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 EMC3Q9P0I2 261 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FAAHO00519 579 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 EMC8O43402 210 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CH25HO95992 272 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 UGT2B7P16662 529 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TYRP1P17643 537 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TAS2R41P59536 307 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PPP1CAP62136 330 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CDK10Q15131 360 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FIGLAQ6QHK4 219 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NRROSQ86YC3 692 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PHC2Q8IXK0 858 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR13H1Q8NG92 308 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR7G2Q8NG99 324 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR5T3Q8NGG3 340 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 S100ZQ8WXG8 99 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TXNDC15Q96J42 360 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 WWP2O00308 870 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 C1QL1O75973 258 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LGI1O95970 557 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SOX3P41225 446 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RGS6P49758 472 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 IFITM3Q01628 133 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RUNX2Q13950 521 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MLC1Q15049 377 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RRM2BQ7LG56 351 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 BBS10Q8TAM1 723 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FCGR1BQ92637 280 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CDS1Q92903 461 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF681Q96N22 645 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 A0A087WUU8 490 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 C4orf47A7E2U8 309 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TBX1O43435 398 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PRKYO43930 277 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GOSR1O95249 250 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 APOA1P02647 267 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ALPPP05187 535 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NPIPA8P0DM63 369 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PSKH1P11801 424 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 AKT2P31751 481 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GPR68Q15743 365 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DEFB119Q8N690 84 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RLN3Q8WXF3 142 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ST8SIA2Q92186 375 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SNAPC3Q92966 411 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC35A4Q96G79 324 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR2A14Q96R47 310 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DSN1Q9H410 356 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.51□□□□□ -1.37
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