RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 FLRT3Q9NZU0 649 aa15.46■□□□□ 0.07
TOM1-216ENST00000492723 CBLCQ9ULV8 474 aa15.46■□□□□ 0.07
TOM1-216ENST00000492723 CARD8Q9Y2G2 431 aa15.46■□□□□ 0.07
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD33BA6NCL7 494 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ADAM11O75078 769 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 GIMD1P0DJR0 217 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 IDUAP35475 653 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ETV5P41161 510 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ETV1P50549 477 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CDK20Q8IZL9 346 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CLDN22Q8N7P3 220 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 KBTBD8Q8NFY9 601 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 OR1L3Q8NH93 324 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 GUCD1Q96NT3 240 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 TAPBPLQ9BX59 468 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 OR52D1Q9H346 318 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 HMG20AQ9NP66 347 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ETAA1Q9NY74 926 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 MED31Q9Y3C7 131 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 SPEGQ15772 3267 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 SLC2A10O95528 541 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 GUSBP08236 651 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 HBQ1P09105 142 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 MYL12AP19105 171 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 PRKCDQ05655 676 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 RAB40BQ12829 278 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ZNF846Q147U1 533 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 C19orf48Q6RUI8 117 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 BCORP1Q8N888 145 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 MCFD2Q8NI22 146 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 BPIFA2Q96DR5 249 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 UBQLN3Q9H347 655 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 AKIP1Q9NQ31 210 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa15.45■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 A0A0B4J2E0 115 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 A0A1B0GWA3 101 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 A0A1B0GX12 115 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 A8MUA0 341 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ZGLP1P0C6A0 271 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 FOLR1P15328 257 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 GAS1P54826 345 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CDH11P55287 796 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ZNF141Q15928 474 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 SHFQ7M4L6 423 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 UBALD2Q8IYN6 164 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 GPR135Q8IZ08 494 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 FNDC8Q8TC99 324 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 HS6ST2Q96MM7 605 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 EVA1AQ9H8M9 152 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CHP2O43745 196 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 HMGN1P05114 100 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 SAGP10523 405 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ATP12AP54707 1039 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 GPLD1P80108 840 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 TMED1Q13445 227 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 FGFBP1Q14512 234 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 LINC00299Q6ZSB3 139 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CARFQ8N187 725 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CADM2Q8N3J6 435 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 D2HGDHQ8N465 521 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 S100ZQ8WXG8 99 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 RFKQ969G6 155 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 OTULINQ96BN8 352 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 TRIM2Q9C040 744 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 MED17Q9NVC6 651 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 PRODH2Q9UF12 536 aa15.44■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 IRGMA1A4Y4 181 aa15.43■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 NPIPB9F8W1W9 429 aa15.43■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CLPSP04118 112 aa15.43■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 GALNSP34059 522 aa15.43■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 LIMK1P53667 647 aa15.43■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 FXYD6P3P58550 94 aa15.43■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 NDUFAF6Q330K2 333 aa15.43■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 C3orf38Q5JPI3 329 aa15.43■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms