RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 SIRPAP78324 504 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 AP1B1Q10567 949 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 FAM53BQ14153 422 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 ADAM5Q6NVV9 412 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 SUSD1Q6UWL2 747 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 SBSNQ6UWP8 590 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 RTL4Q6ZR62 310 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 PRSS45Q7RTY3 260 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 PCGF5Q86SE9 256 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 DENND6AQ8IWF6 608 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 MCOLN2Q8IZK6 566 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 SVOPLQ8N434 492 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 PQLC3Q8N755 202 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 ANKRD42Q8N9B4 389 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CCNYQ8ND76 341 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 B3GNT7Q8NFL0 401 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 MAGEC3Q8TD91 643 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 RAB40AQ8WXH6 277 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 NTNG2Q96CW9 530 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 RNF183Q96D59 192 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 FAM81BQ96LP2 452 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 COPS8Q99627 209 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 FICDQ9BVA6 458 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CACNG6Q9BXT2 260 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 PIGMQ9H3S5 423 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 PPCSQ9HAB8 311 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 HOMER3Q9NSC5 361 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CRLS1Q9UJA2 301 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa3.8□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 IQCF5A8MTL0 148 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 F8VZ95 297 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 G3V4G9 280 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CHST10O43529 356 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 OR1I1O60431 355 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 SERPINI2O75830 405 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CLDN9O95484 217 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 FTCDO95954 541 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 AGTP01019 485 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 P04436 131 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CALB1P05937 261 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 FHP07954 510 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CYC1P08574 325 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 NUDT17P0C025 328 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 FCGR1AP12314 374 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 HSD3B1P14060 373 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 TBXA2RP21731 343 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 GDF1P27539 372 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CCR7P32248 378 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 SLC6A12P48065 614 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 DIO3P55073 304 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 KRTAP10-3P60369 221 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 KCNJ2P63252 427 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 SLC18A2Q05940 514 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 TSC22D1Q15714 1073 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CCDC122Q5T0U0 273 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 KCTD11Q693B1 232 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 C11orf71Q6IPW1 123 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CREB3L2Q70SY1 520 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CLIP4Q8N3C7 705 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 PROX1Q92786 737 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 SLC22A18Q96BI1 424 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 DUX5Q96PT3 197 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 LYSTQ99698 3801 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 APOL2Q9BQE5 337 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 SLC25A51Q9H1U9 297 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CLCF1Q9UBD9 225 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 AMACRQ9UHK6 382 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 MAN1B1Q9UKM7 699 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.79□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.78□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.78□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa3.78□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa3.78□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 CTAGE15A4D2H0 777 aa3.78□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 DPRXA6NFQ7 191 aa3.78□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 OR51F1A6NGY5 319 aa3.78□□□□□ -1.8
CNN3-206ENST00000487539 TMCO5BA8MYB1 307 aa3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms