RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486204.5

SSR4-211, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-211ENST00000486204 NDUFAF1Q9Y375 327 aa11.71□□□□□ -0.53
SSR4-211ENST00000486204 WDR45Q9Y484 360 aa11.71□□□□□ -0.53
SSR4-211ENST00000486204 OR14I1A6ND48 311 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 FXYD1O00168 92 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 SCDO00767 359 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 ANGPT2O15123 496 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 NDUFB5O43674 189 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 UGT2B17O75795 530 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 TRAPPC6AO75865 159 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 H6PDO95479 791 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 NUDT7P0C024 238 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 TFPTP0C1Z6 253 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 ABOP16442 354 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 CLK3P49761 638 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 B3GALT5-AS1P59052 145 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 CHRNEQ04844 493 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 LTBQ06643 244 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 C17orf67Q0P5P2 114 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 RGNQ15493 299 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 GPR68Q15743 365 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 MAPK14Q16539 360 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 NHSL2Q5HYW2 709 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 DCST1Q5T197 706 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 PDZK1Q5T2W1 519 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 ACBD4Q8NC06 268 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 FOXC2Q99958 501 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 CXXC4Q9H2H0 198 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 SDHAF3Q9NRP4 125 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 MED11Q9P086 117 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 LIPT1Q9Y234 373 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 DTNAQ9Y4J8 743 aa11.7□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 NPIPA2E9PIF3 369 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 NPIPA3F8WFD2 350 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 SLC22A2O15244 555 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 ZIC3O60481 467 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 TPOP07202 933 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 FOSL1P15407 271 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 HPGDP15428 266 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 GPX2P18283 190 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 DPP4P27487 766 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 CRATP43155 626 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 GFRA1P56159 465 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 ZNF117Q03924 483 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 FADDQ13158 208 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 GANABQ14697 944 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 TOMM20Q15388 145 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 TMEM44Q2T9K0 475 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 NDUFAF6Q330K2 333 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 GPAT3Q53EU6 434 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 RUNDC3AQ59EK9 446 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 COQ5Q5HYK3 327 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 VASNQ6EMK4 673 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 CBLN3Q6UW01 205 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 CD163Q86VB7 1156 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 SNX32Q86XE0 403 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 DOLPP1Q86YN1 238 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 TREML1Q86YW5 311 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 MISPQ8IVT2 679 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 ZNF619Q8N2I2 560 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 ZNF527Q8NB42 609 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 OR4K17Q8NGC6 315 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 OIT3Q8WWZ8 545 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 ZG16BQ96DA0 208 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 ANKRD27Q96NW4 1050 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 CGREF1Q99674 301 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 CCDC106Q9BWC9 280 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 MYLK2Q9H1R3 596 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 LDAHQ9H6V9 325 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 PNPLA3Q9NST1 481 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 P2RX2Q9UBL9 471 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 ICAM5Q9UMF0 924 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 SLC6A5Q9Y345 797 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 CAPN7Q9Y6W3 813 aa11.69□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 SERINC4A6NH21 518 aa11.68□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 BBIP1A8MTZ0 92 aa11.68□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 BCHEP06276 602 aa11.68□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 BMP7P18075 431 aa11.68□□□□□ -0.54
SSR4-211ENST00000486204 PPIBP23284 216 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms