RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 NUDT8Q8WV74 236 aa15.11■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.11■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 KLHL15Q96M94 604 aa15.11■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 TRMOQ9BU70 441 aa15.11■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 BDH2Q9BUT1 245 aa15.11■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 BTBD2Q9BX70 525 aa15.11■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 GLRX2Q9NS18 164 aa15.11■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 GIN1Q9NXP7 522 aa15.11■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 MID2Q9UJV3 735 aa15.11■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 NPIPA7E9PJI5 369 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 OIP5O43482 229 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 TUBBP07437 444 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 NPIPA8P0DM63 369 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 NID1P14543 1247 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 PCSK6P29122 969 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 HPCAL1P37235 193 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 ASMTP46597 345 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 BEND4Q6ZU67 534 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 TRABD2AQ86V40 505 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 OR7A2PQ8NGA2 310 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 RNF128Q8TEB7 428 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 ABHD3Q8WU67 409 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 ROBO4Q8WZ75 1007 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 MTERF3Q96E29 417 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 CHMP6Q96FZ7 201 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 PLPPR2Q96GM1 343 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 SRXN1Q9BYN0 137 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 PPCSQ9HAB8 311 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 DUSP22Q9NRW4 184 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 SNX8Q9Y5X2 465 aa15.1■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 CUBNO60494 3623 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM13O60858 407 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 NR1H2P55055 460 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 CARD18P57730 90 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 MLC1Q15049 377 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 UGT3A2Q3SY77 523 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 CBLN3Q6UW01 205 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 STK32CQ86UX6 486 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 AGR3Q8TD06 166 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM171Q8WVE6 324 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 OSTF1Q92882 214 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 S100PBPQ96BU1 408 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 STACQ99469 402 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM204Q9BSN7 226 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 MECRQ9BV79 373 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 PIGUQ9H490 435 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP6V1HQ9UI12 483 aa15.09■□□□□ 0.01
SKIV2L-211ENST00000485349 EFNA2O43921 213 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 NTN1O95631 604 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 HSPA4LO95757 839 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 LAMP1P11279 417 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 PAX1P15863 534 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 ELK4P28324 431 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 ALDH3A1P30838 453 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 EIF1P41567 113 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 PTGR1Q14914 329 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 TSC22D1Q15714 1073 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 NDUFAF6Q330K2 333 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 XKR7Q5GH72 579 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 PDSS1Q5T2R2 415 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 ALKBH2Q6NS38 261 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 CDC73Q6P1J9 531 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 LRIG3Q6UXM1 1119 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 PRIMA1Q86XR5 153 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 APOPT1Q96IL0 206 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 C1orf50Q9BV19 199 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 CXorf36Q9H7Y0 433 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 FANCFQ9NPI8 374 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 MKS1Q9NXB0 559 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 ICAM5Q9UMF0 924 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 CARD8Q9Y2G2 431 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR52Q9Y2T5 361 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 TRAF6Q9Y4K3 522 aa15.08■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM114B3SHH9 223 aa15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 HS3ST1O14792 307 aa15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 NPHS1O60500 1241 aa15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 PEX11AO75192 247 aa15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 NUDT14O95848 222 aa15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 FGF4P08620 206 aa15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP6V1C1P21283 382 aa15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 TP53BP2Q13625 1128 aa15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 KLHL26Q53HC5 615 aa15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 DCST2Q5T1A1 773 aa15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 TFAP2EQ6VUC0 442 aa15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 GABRG1Q8N1C3 465 aa15.07■□□□□ 0
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF611Q8N823 705 aa15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms