RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482190.1

RBBP4-212, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 3

Gene RBBP4, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-212ENST00000482190 CLEC20AQ6ZU45 233 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 SH2D5Q6ZV89 423 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 ARCQ7LC44 396 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 C1QL2Q7Z5L3 287 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 KRT77Q7Z794 578 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 DHDDSQ86SQ9 333 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 CCDC190Q86UF4 302 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 TMEM126BQ8IUX1 230 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 MAP7D3Q8IWC1 876 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 RFLNBQ8N5W9 214 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 AMER3Q8N944 861 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 SLC4A11Q8NBS3 891 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 OR5B17Q8NGF7 314 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 JOSD2Q8TAC2 188 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 THAP6Q8TBB0 222 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 HM13Q8TCT9 377 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 SLC37A2Q8TED4 501 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 FAM216AQ8WUB2 273 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 FAM172AQ8WUF8 416 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 HAS2Q92819 552 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 ORAI1Q96D31 301 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 TMCO6Q96DC7 493 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 TGM7Q96PF1 710 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 SPATA16Q9BXB7 569 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 RTN4RQ9BZR6 473 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 KLHL4Q9C0H6 718 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 MMP27Q9H306 513 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 C10orf88Q9H8K7 445 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 S100A14Q9HCY8 104 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 PCSK1NQ9UHG2 260 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 PLAGL1Q9UM63 463 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 HS3ST2Q9Y278 367 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 HERC2O95714 4834 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 USF3Q68DE3 2245 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 SEC16AO15027 2179 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 A0A1W2PPE2 198 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 A0A1W2PR64 198 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 FAM159BA6NKW6 160 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 H7C0S8 307 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 UBE2CO00762 179 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 TXNDC9O14530 226 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 ADAMDEC1O15204 470 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 BUD23O43709 281 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 PRPSAP2O60256 369 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 NDUFS7O75251 213 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 GLRA3O75311 464 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 SNNO75324 88 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 WISP2O76076 250 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 PCCBP05166 539 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 CAPN1P07384 714 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 CD48P09326 243 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 P4HA1P13674 534 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 NELFEP18615 380 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 PRDX6P30041 224 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 ACTR1BP42025 376 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 CAPZA2P47755 286 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 SLC1A6P48664 564 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 ZNF81P51508 661 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 CDH6P55285 790 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 ACTR1AP61163 376 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 ACTG1P63261 375 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 SIRPAP78324 504 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 ABATP80404 500 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 NAB1Q13506 487 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 ITGA9Q13797 1035 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 SQLEQ14534 574 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 PDK2Q15119 407 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 PTPN20Q4JDL3 420 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 NADSYN1Q6IA69 706 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 ZNF425Q6IV72 752 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 LCN10Q6JVE6 187 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 KRT80Q6KB66 452 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 TIFABQ6ZNK6 161 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 RAPH1Q70E73 1250 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 PRSS42Q7Z5A4 293 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 LGI2Q8N0V4 545 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 NDUFAF2Q8N183 169 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 BEST3Q8N1M1 668 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 CRYBG2Q8N1P7 616 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 SFRP1Q8N474 314 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-212ENST00000482190 MARVELD2Q8N4S9 558 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms