RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 SERINC4A6NH21 518 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 H3BNH8 94 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ANP32DO95626 131 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 GUCY1A3Q02108 690 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 MAPK14Q16539 360 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 SYPL1Q16563 259 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 C6orf10Q5SRN2 563 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ANKFN1Q8N957 763 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 NAXEQ8NCW5 288 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 SPDL1Q96EA4 605 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 UCN2Q96RP3 112 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ZNF385DQ9H6B1 395 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 CHST11Q9NPF2 352 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 WDR45Q9Y484 360 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 A0A0G2JND7 137 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 NKX2-6A6NCS4 301 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 FAM90A27PA6NNH2 459 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 CLCA1A8K7I4 914 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 HSPB2A8KAH6 182 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 H6PDO95479 791 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 CAPN3P20807 821 aa18.91■□□□□ 0.62
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ACTB-211ENST00000480301 HSPB2Q16082 182 aa18.91■□□□□ 0.62
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ACTB-211ENST00000480301 NDUFAF6Q330K2 333 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 GPAT3Q53EU6 434 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 AGKQ53H12 422 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ZNF619Q8N2I2 560 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 C9orf106Q8NAJ2 232 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 POC1BQ8TC44 478 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB8AQ96BR9 441 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ZG16BQ96DA0 208 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
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ACTB-211ENST00000480301 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 LIPT1Q9Y234 373 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 C7orf72A4D263 438 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 H0YC42 278 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 H3BML4 177 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 NR5A2O00482 541 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 LINGO3P0C6S8 592 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ZNF17P17021 662 aa18.9■□□□□ 0.62
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ACTB-211ENST00000480301 MAPK11Q15759 364 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 PAGE3Q5JUK9 113 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 CGB2Q6NT52 195 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 POMZP3Q6PJE2 187 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 PLXDC2Q6UX71 529 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 UBQLNLQ8IYU4 475 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 GPR119Q8TDV5 335 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 OIT3Q8WWZ8 545 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ZNF524Q96C55 264 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 SLC38A1Q9H2H9 487 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 CCDC134Q9H6E4 229 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ16Q9NPI9 418 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 SLAMF8Q9P0V8 285 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 CLCF1Q9UBD9 225 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 AP4B1Q9Y6B7 739 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa18.9■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 A0A096LPI6 279 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 ZNF264O43296 627 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 IL2RAP01589 272 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 CHRM4P08173 479 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 UBL4AP11441 157 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 ETFAP13804 333 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 FGFBP1Q14512 234 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 LRIF1Q5T3J3 769 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 MSRB3Q8IXL7 192 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 MEIOBQ8N635 442 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 WNT2BQ93097 391 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 ARSGQ96EG1 525 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 RNF145Q96MT1 663 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 LAT2Q9GZY6 243 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 RABEP2Q9H5N1 569 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 TRIM33Q9UPN9 1127 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 L3MBTL1Q9Y468 752 aa18.89■□□□□ 0.61
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