RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 ABCA4P78363 2273 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TACC2O95359 2948 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 E9PMD0 336 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 K7EQS6 105 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 SGK494L7N484 410 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 SGK1O00141 431 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TSC22D2O75157 780 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA0754O94854 1291 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 SEC24AO95486 1093 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ADCY5O95622 1261 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHV4-59P01825 116 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 IGKV2-30P06310 120 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 RGS4P49798 205 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 DRP2Q13474 957 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF74Q16587 644 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CFAP221Q4G0U5 840 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGAP17Q68EM7 881 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC8BQ6P9F7 803 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 KDM7AQ6ZMT4 941 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 PAQR9Q6ZVX9 377 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 C17orf64Q86WR6 236 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM131BQ86XD5 332 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CBWD2Q8IUF1 395 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC185Q8N715 623 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 GIPC3Q8TF64 312 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 FCAMRQ8WWV6 532 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 LMLNQ96KR4 655 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 LURAP1Q96LR2 239 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 IL17FQ96PD4 163 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CCT7Q99832 543 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ALG12Q9BV10 488 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 VPS37BQ9H9H4 285 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 S100A14Q9HCY8 104 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 GDF3Q9NR23 364 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP6V1HQ9UI12 483 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 GRID1Q9ULK0 1009 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF175Q9Y473 711 aa4.84□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 POLEQ07864 2286 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 XKRY2A2RUG3 117 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ARL5CA6NH57 179 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 SH2D1BO14796 132 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 TM7SF2O76062 418 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 NDUFA7O95182 113 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 IL1BP01584 269 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 POLR2MP0CAP2 368 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 AXLP30530 894 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 OR3A2P47893 321 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC26A2P50443 739 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 GBE1Q04446 702 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 LTBQ06643 244 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF699Q32M78 642 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 FGD3Q5JSP0 725 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 SPANXN4Q5MJ08 99 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 PMF1Q6P1K2 205 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 LSMEM2Q8N112 164 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ELMOD1Q8N336 334 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 OR8J1Q8NGP2 316 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 SECTM1Q8WVN6 248 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 DNASE2BQ8WZ79 361 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 CD101Q93033 1021 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBTB9Q96C00 473 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 HMCESQ96FZ2 354 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 VPS35Q96QK1 796 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT12Q99456 494 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBTB18Q99592 522 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 IL12RB2Q99665 862 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 MEAF6Q9HAF1 191 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 CLEC4AQ9UMR7 237 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 PLCL2Q9UPR0 1127 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 SCN8AQ9UQD0 1980 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa4.83□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa4.82□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 GSAPA4D1B5 854 aa4.82□□□□□ -1.64
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