RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469511.1

PTPN4-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 476 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-209	ENST00000469511	ZNF83	P51522	516 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	EFNA4	P52798	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	DLG1	Q12959	904 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	TRIP10	Q15642	601 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	TBCC	Q15814	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	C4orf22	Q6V702	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	MUC15	Q8N387	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	HSD17B8	Q92506	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	CD274	Q9NZQ7	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ARMCX1	Q9P291	453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511		H7C417	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	UBXN8	O00124	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	IGKV1D-16	P01601	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	TUBB	P07437	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ZNF23	P17027	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ENPP1	P22413	925 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	EVI2B	P34910	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ELK3	P41970	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	PDLIM4	P50479	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	PPA1	Q15181	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	CARM1	Q86X55	608 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-209	ENST00000469511	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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