RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 AP3D1O14617 1153 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 E2F6O75461 281 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 NTN1O95631 604 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 RYKP34925 604 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 TMED10P49755 219 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 RAPSNQ13702 412 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 CLEC1AQ8NC01 280 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 ASB15Q8WXK1 588 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 ZNF524Q96C55 264 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 REEP1Q9H902 201 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 HEATR5AQ86XA9 2040 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 NCOR2Q9Y618 2525 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 B4DXG7 233 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 NDUFB5O43674 189 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 GMFGO60234 142 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 DPM1O60762 260 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 ANGPTL1O95841 491 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 UBL4AP11441 157 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 SKP2Q13309 424 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 OPN5Q6U736 354 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 CBR4Q8N4T8 237 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 TMEM156Q8N614 296 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 RNF138Q8WVD3 245 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 THAP4Q8WY91 577 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 TTC9Q92623 222 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 TMCO6Q96DC7 493 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 HRH3Q9Y5N1 445 aa21.3■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 ACACAQ13085 2346 aa21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 A0A1W2PQD3 144 aa21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 VHLP40337 213 aa21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 ZNF117Q03924 483 aa21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 OR5M10Q6IEU7 315 aa21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 BEST3Q8N1M1 668 aa21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 GALNT4Q8N4A0 578 aa21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 ZNF248Q8NDW4 579 aa21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 OR4C15Q8NGM1 316 aa21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 OIT3Q8WWZ8 545 aa21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 PRRC1Q96M27 445 aa21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 LHPPQ9H008 270 aa21.29■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 A6NL46 340 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 G3V2T6 193 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 TNFRSF11BO00300 401 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 ADAMDEC1O15204 470 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 ZNF264O43296 627 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 F10P00742 488 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 PTGDSP41222 190 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 LIMS1P48059 325 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 GAS1P54826 345 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 DUSP19Q8WTR2 217 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 DHRS1Q96LJ7 313 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 KLHL4Q9C0H6 718 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 ING2Q9H160 280 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 STMN3Q9NZ72 180 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 MGAQ8IWI9 3026 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 GADD45GO95257 159 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 TAS2R41P59536 307 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 MEP1AQ16819 746 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 MDGA2Q7Z553 956 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 STK32CQ86UX6 486 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 CYP4Z1Q86W10 505 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 GALNT16Q8N428 558 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 OR5K1Q8NHB7 308 aa21.28■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 HCRTR2O43614 444 aa21.27■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 HMGA2P52926 109 aa21.27■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 CDC20Q12834 499 aa21.27■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 OR1Q1Q15612 314 aa21.27■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa21.27■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 PIK3C3Q8NEB9 887 aa21.27■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 EPYCQ99645 322 aa21.27■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 FNDC11Q9BVV2 318 aa21.27■■□□□ 1
CNN3-202ENST00000394202 PCNX3Q9H6A9 2034 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 H3BNH8 94 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 EI24O14681 340 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 H1F0P07305 194 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 CCL3P10147 92 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 CASP3P42574 277 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 EPS8Q12929 822 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 SEC23BQ15437 767 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 ZSWIM7Q19AV6 140 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 COLEC12Q5KU26 742 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 PRAMEF20Q5VT98 475 aa21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms