RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384526.1

RNU6-880P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 880, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-880P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-880P-201ENST00000384526 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 HSPA14Q0VDF9 509 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 KCNJ11Q14654 390 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 DDI2Q5TDH0 399 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 PM20D1Q6GTS8 502 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARMCX2Q7L311 632 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 ADM2Q7Z4H4 148 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 PARGQ86W56 976 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 LHX4Q969G2 390 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 TIMD4Q96H15 378 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 TMEM80Q96HE8 168 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 BMFQ96LC9 184 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF558Q96NG5 402 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 GCNAQ96QF7 691 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 RNF126Q9BV68 326 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 KATNB1Q9BVA0 655 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 CHIAQ9BZP6 476 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 FAM129AQ9BZQ8 928 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SYNCQ9H7C4 482 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC25A22Q9H936 323 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 BTNL2Q9UIR0 455 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 FBXL5Q9UKA1 691 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 FREM2Q5SZK8 3169 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 USP6P35125 1406 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 A0A0J9YXV3 536 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 CHUKO15111 745 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 CHRNA1P02708 482 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC4A1P02730 911 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 IL4P05112 153 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 PGK2P07205 417 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 GIPP09681 153 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 DCAF7P61962 342 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARF1P84077 181 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 ACVR1Q04771 509 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 FMODQ06828 376 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 ALCAMQ13740 583 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARMC4Q5T2S8 1044 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 PRR5LQ6MZQ0 368 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SPINT4Q6UDR6 99 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 LINC00518Q8N0U6 118 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR5W2Q8NH69 310 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZFP90Q8TF47 636 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 CKAP2Q8WWK9 683 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 DOCK10Q96BY6 2186 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 COG3Q96JB2 828 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 RNF5Q99942 180 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC26A6Q9BXS9 759 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 DCTPP1Q9H773 170 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 CALHM2Q9HA72 323 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 LINC00846Q9NV44 126 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 AIG1Q9NVV5 245 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SWAP70Q9UH65 585 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 F8P00451 2351 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 CFAP54Q96N23 3096 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 PDLIM1O00151 329 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF263O14978 683 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SNAPINO95295 136 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 AGR2O95994 175 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 CHTF8P0CG12 524 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC3A1Q07837 685 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 SYCNQ0VAF6 134 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 IHHQ14623 411 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 CYP51A1Q16850 503 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 DNM1P46Q6ZS02 220 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 TCF24Q7RTU0 167 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 THEM5Q8N1Q8 247 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 LRRC52Q8N7C0 313 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 POGLUT1Q8NBL1 392 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 ACBD4Q8NC06 268 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 NECAP1Q8NC96 275 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR4F17Q8NGA8 305 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF502Q8TBZ5 544 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 L3HYPDHQ96EM0 354 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR4F4Q96R69 305 aa-0.69□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.2 ms