RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 SSR4P51571 173 aa16.29■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ZNF117Q03924 483 aa16.29■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 SKP2Q13309 424 aa16.29■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 COLEC12Q5KU26 742 aa16.29■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 CBLN3Q6UW01 205 aa16.29■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 HIPK1Q86Z02 1210 aa16.29■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 CADM2Q8N3J6 435 aa16.29■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 PIK3C3Q8NEB9 887 aa16.29■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 OR9Q2Q8NGE9 314 aa16.29■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ALPK1Q96QP1 1244 aa16.29■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa16.29■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD10Q9NXR5 420 aa16.29■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ALG1L2C9J202 215 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 DPM1O60762 260 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ANGPTL1O95841 491 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 THY1P04216 161 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ARHGDIAP52565 204 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 IL1RL1Q01638 556 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 DAG1Q14118 895 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 SEC23BQ15437 767 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 OR1Q1Q15612 314 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 NUP54Q7Z3B4 507 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 OFCC1Q8IZS5 231 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 TMEM156Q8N614 296 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 DNAJC9Q8WXX5 260 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 TMCO6Q96DC7 493 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 SLC41A3Q96GZ6 507 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 IP6K3Q96PC2 410 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 KLRF1Q9NZS2 232 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 KIF17Q9P2E2 1029 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 SLC7A7Q9UM01 511 aa16.28■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 EXPH5Q8NEV8 1989 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 C7orf72A4D263 438 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ZNF264O43296 627 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 HCRTR2O43614 444 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 CCNB2O95067 398 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 NGFRP08138 427 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 NAGAP17050 411 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 LIMS1P48059 325 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 RAPSNQ13702 412 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 OPN5Q6U736 354 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ZNF550Q7Z398 422 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 GDF7Q7Z4P5 450 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 SLC15A4Q8N697 577 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 FAM71CQ8NEG0 241 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 OR10G2Q8NGC3 310 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 GIPC3Q8TF64 312 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 DHRS1Q96LJ7 313 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ZNF559Q9BR84 538 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 METTL7AQ9H8H3 244 aa16.27■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 NINQ8N4C6 2090 aa16.27■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 MITFO75030 526 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 F10P00742 488 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 NTRK2Q16620 822 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 PRAMEF20Q5VT98 475 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 OR5M10Q6IEU7 315 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 PODNL1Q6PEZ8 512 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 GALNT5Q7Z7M9 940 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 PACRGLQ8N7B6 248 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ATG16L2Q8NAA4 619 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 SLC7A13Q8TCU3 470 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 PSMF1Q92530 271 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 OSBPL10Q9BXB5 764 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 TMCC3Q9ULS5 477 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 WASF3Q9UPY6 502 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 HRH3Q9Y5N1 445 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 A0A1W2PQD3 144 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ADAM10O14672 748 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 OR5F1O95221 314 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ADH7P40394 386 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ALDH3A2P51648 485 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 SMIM11AP58511 58 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 PPP2R2BQ00005 443 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 EPS8Q12929 822 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ZSWIM7Q19AV6 140 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 MICAQ29983 383 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ACER2Q5QJU3 275 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 DCST1Q5T197 706 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 NKAIN4Q8IVV8 208 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 BEST3Q8N1M1 668 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 CLEC1AQ8NC01 280 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 DUSP19Q8WTR2 217 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 OIT3Q8WWZ8 545 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 TMEM27Q9HBJ8 222 aa16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 CFAP54Q96N23 3096 aa16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms