RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 GJB5O95377 273 aa20.27■□□□□ 0.84
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OPN3-201ENST00000366554 NPC1O15118 1278 aa20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ZNF749O43361 778 aa20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 PAICSP22234 425 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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OPN3-201ENST00000366554 OR7E24Q6IFN5 339 aa20.24■□□□□ 0.83
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