RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 CPTPQ5TA50 214 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 GIMAP5Q96F15 307 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC35A4Q96G79 324 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 NODALQ96S42 347 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 DEFB127Q9H1M4 99 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRSS50Q9UI38 385 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 FLNCQ14315 2725 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 NCKAP5O14513 1909 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A1B0GTH9 108 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A1W2PRB8 838 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 WIPF3A6NGB9 483 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR6C70A6NIJ9 312 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADAM10O14672 748 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRRTM2O43300 516 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC19A2O60779 497 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 REM1O75628 298 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDE9AO76083 593 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 AGFG2O95081 481 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 LY86O95711 162 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 C6orf47O95873 294 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 ACP2P11117 423 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 EPHA3P29320 983 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRKAG1P54619 331 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 GAB1Q13480 694 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 PGS1Q32NB8 556 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM81Q6P7N7 255 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 GHDCQ8N2G8 530 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 NATD1Q8N6N6 113 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNF138Q8WVD3 245 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF503Q96F45 646 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 TEX37Q96LM6 180 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 C7orf26Q96N11 449 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 RILPQ96NA2 401 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 COL21A1Q96P44 957 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 DOHHQ9BU89 302 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 DUSP26Q9BV47 211 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 DPY30Q9C005 99 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 EQTNQ9NQ60 294 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 AIG1Q9NVV5 245 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 TINAGQ9UJW2 476 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 NBASA2RRP1 2371 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A1B0GVC2 190 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 B4DXG7 233 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 EMC8O43402 210 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCN2BO60939 215 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 ICOSLGO75144 302 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 NKX2-2O95096 273 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 SNX4O95219 450 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 LDLRP01130 860 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGKV1D-16P01601 117 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHG3P01860 377 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 IL12AP29459 219 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 IL12BP29460 328 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 GABRA3P34903 492 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 CA7P43166 264 aa6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms