RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347547.6

LRP8-202, Transcript of LDL receptor related protein 8, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP8, Length 2,382 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP8-202ENST00000347547 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ARL9Q6T311 187 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 FANK1Q8TC84 345 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ORAI1Q96D31 301 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 LRRC46Q96FV0 321 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PINK1Q9BXM7 581 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SLC19A3Q9BZV2 496 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 OR10A4Q9H209 315 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 TDP1Q9NUW8 608 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 F8W036 122 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 KLF4O43474 513 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 MTX2O75431 263 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 STX11O75558 287 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 EPXP11678 715 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ATF1P18846 271 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ADCK2Q7Z695 626 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PAQR7Q86WK9 346 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 MEIOBQ8N635 442 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 THEM6Q8WUY1 208 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ZNF480Q8WV37 535 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 FOXJ1Q92949 421 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 UBE2E3Q969T4 207 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 TMEM159Q96B96 161 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 CREBZFQ9NS37 354 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 NTMQ9P121 344 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 A0A1B0GTQ1 180 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ALPPL2P10696 532 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 TBXA2RP21731 343 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SDHBP21912 280 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 VIPR1P32241 457 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 CAPZA2P47755 286 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 TAS2R41P59536 307 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 KRT33BQ14525 404 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 TMEM99Q8N816 258 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 OR4D9Q8NGE8 314 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 FANCFQ9NPI8 374 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 RCE1Q9Y256 329 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 NINQ8N4C6 2090 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 H7C2Y5 167 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SYT5O00445 386 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 EOMESO95936 686 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PAICSP22234 425 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 MLC1Q15049 377 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 NIPAL3Q6P499 406 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 CPOQ8IVL8 374 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 OR2T33Q8NG76 320 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 DIO2Q92813 273 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ART5Q96L15 291 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 NDC1Q9BTX1 674 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 AHSPQ9NZD4 102 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ZNF69Q9UC07 566 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 CKAP5Q14008 2032 aa14.58□□□□□ -0.08
LRP8-202ENST00000347547 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.58□□□□□ -0.08
LRP8-202ENST00000347547 DAPL1A0PJW8 107 aa14.58□□□□□ -0.08
LRP8-202ENST00000347547 APOC1P02654 83 aa14.58□□□□□ -0.08
LRP8-202ENST00000347547 ATP1B1P05026 303 aa14.58□□□□□ -0.08
LRP8-202ENST00000347547 HSPB3Q12988 150 aa14.58□□□□□ -0.08
LRP8-202ENST00000347547 PLD1Q13393 1074 aa14.58□□□□□ -0.08
LRP8-202ENST00000347547 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.58□□□□□ -0.08
LRP8-202ENST00000347547 HTR3DQ70Z44 454 aa14.58□□□□□ -0.08
LRP8-202ENST00000347547 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LRP8-202ENST00000347547 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LRP8-202ENST00000347547 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.58□□□□□ -0.08
LRP8-202ENST00000347547 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms