RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 EVI2BP34910 448 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ACVR1BP36896 505 aa6.76□□□□□ -1.33
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PTPRR-202ENST00000342084 ABATP80404 500 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TNFRSF17Q02223 184 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PLAURQ03405 335 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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PTPRR-202ENST00000342084 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.76□□□□□ -1.33
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PTPRR-202ENST00000342084 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CDC73Q6P1J9 531 aa6.76□□□□□ -1.33
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PTPRR-202ENST00000342084 SYT9Q86SS6 491 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ASPGQ86U10 573 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PAQR7Q86WK9 346 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ARL14Q8N4G2 192 aa6.76□□□□□ -1.33
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PTPRR-202ENST00000342084 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR5T3Q8NGG3 340 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR52N1Q8NH53 320 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR51A7Q8NH64 312 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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PTPRR-202ENST00000342084 SDF2Q99470 211 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 APOOQ9BUR5 198 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SLC17A9Q9BYT1 436 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 MYO10Q9HD67 2058 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRR-202ENST00000342084 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRR-202ENST00000342084 J3QLW9 94 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 BHLHE40O14503 412 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRR-202ENST00000342084 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CHST10O43529 356 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRR-202ENST00000342084 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRR-202ENST00000342084 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 IGFLR1Q9H665 355 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 KLHL1Q9NR64 748 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 STARD5Q9NSY2 213 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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