RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 NID1P14543 1247 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 NDUFS1P28331 727 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 GNG2P59768 71 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 MAB21L1Q13394 359 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PLA1AQ53H76 456 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 BICRALQ6AI39 1079 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 OR5W2Q8NH69 310 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 APOOQ9BUR5 198 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 MCUBQ9NWR8 336 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 GDE1Q9NZC3 331 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 DAPL1A0PJW8 107 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SC5DO75845 299 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SLC35G6P0C7Q6 338 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PRG2P13727 222 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 CPMP14384 443 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 BMP7P18075 431 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 NPR2P20594 1047 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TALDO1P37837 337 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 WASP42768 502 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 CLDN2P57739 230 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 GPR176Q14439 515 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 MAPK14Q16539 360 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SDE2Q6IQ49 451 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 OR4M1Q8NGD0 313 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 LCN9Q8WX39 176 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 RFT1Q96AA3 541 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 WACQ9BTA9 647 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 HCAR1Q9BXC0 346 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 MED20Q9H944 212 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ENAMQ9NRM1 1142 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 CLDND1Q9NY35 253 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1W2PQU0 124 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 BTN3A3O00478 584 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF9O43307 516 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 STX11O75558 287 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 OR1Q1Q15612 314 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 B3GLCTQ6Y288 498 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PXKQ7Z7A4 578 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PFN4Q8NHR9 129 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 COL26A1Q96A83 441 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 NDC1Q9BTX1 674 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 FGF22Q9HCT0 170 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 DUSP22Q9NRW4 184 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 C20orf141Q9NUB4 165 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0G2JK05 382 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 CDHR4A6H8M9 788 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 IFI6P09912 130 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 IFI30P13284 250 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM240Q5SV17 173 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 DCST2Q5T1A1 773 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SFXN4Q6P4A7 337 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TEX19Q8NA77 164 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SLC37A3Q8NCC5 494 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SLC2A12Q8TD20 617 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ZFPM2Q8WW38 1151 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PMM1Q92871 262 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 OR2M4Q96R27 311 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ENKD1Q9H0I2 346 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 DAPP1Q9UN19 280 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 A0A087WV62 115 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SLC2A5P22732 501 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SHC1P29353 583 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PITPNBP48739 271 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 FOXK2Q01167 660 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 GPR68Q15743 365 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 CCNJQ5T5M9 372 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PTP4A1Q93096 173 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 OR2A5Q96R48 311 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 STACQ99469 402 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 HDHD2Q9H0R4 259 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 HAO2Q9NYQ3 351 aa20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms