RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 GABRA5P31644 462 aa22.18■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 GKN2Q86XP6 184 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF595Q8IYB9 648 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 PSD4Q8NDX1 1056 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 GRHL3Q8TE85 626 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 SLC25A46Q96AG3 418 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 BPIFA2Q96DR5 249 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 CPNE5Q9HCH3 593 aa22.18■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 TBXA2RP21731 343 aa22.17■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 HRO43593 1189 aa22.16■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 SSTR4P31391 388 aa22.16■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 ATP6V1E1P36543 226 aa22.16■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 OR6C4Q8NGE1 309 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 OR13C2Q8NGS9 318 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 ARSGQ96EG1 525 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 VSTM2LQ96N03 204 aa22.16■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 RERGLQ9H628 205 aa22.16■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 PLBD1Q6P4A8 553 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.16■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 OR52N1Q8NH53 320 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 ABHD8Q96I13 439 aa22.16■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 SLC38A3Q99624 504 aa22.16■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 TPK1Q9H3S4 243 aa22.16■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 HRKO00198 91 aa22.15■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 SMARCD3Q6STE5 483 aa22.15■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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TRIM54-201ENST00000296098 CA14Q9ULX7 337 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 DTX4Q9Y2E6 619 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 A0A1B0GWA3 101 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 A0A1W2PR77 199 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 CLDN4O14493 209 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-201ENST00000296098 PRAMEF2O60811 474 aa22.14■■□□□ 1.14
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