RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291901.12

TNNT1-201, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 967 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-201ENST00000291901 STK32CQ86UX6 486 aa14.95□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.95□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.95□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 AGR3Q8TD06 166 aa14.95□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ABHD3Q8WU67 409 aa14.95□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 KLHL15Q96M94 604 aa14.95□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 GLRX2Q9NS18 164 aa14.95□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.95□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 C7orf72A4D263 438 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 EFNA2O43921 213 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 CHRNGP07510 517 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 LINGO3P0C6S8 592 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 NEFHP12036 1026 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF844Q08AG5 666 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 CBLN3Q6UW01 205 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TRABD2AQ86V40 505 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TUSC5Q8IXB3 177 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 FBXO27Q8NI29 283 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 S100PBPQ96BU1 408 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 BTBD2Q9BX70 525 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 HHATLQ9HCP6 504 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 FANCFQ9NPI8 374 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 USF3Q68DE3 2245 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.94□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 HS3ST1O14792 307 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 PIP5K1BO14986 540 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TRIM13O60858 407 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 LAMP1P11279 417 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ATP6V1C1P21283 382 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ASMTP46597 345 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ATP5J2P56134 94 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 MISPQ8IVT2 679 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 MECRQ9BV79 373 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 CARD8Q9Y2G2 431 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.93□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 A0A1W2PQD3 144 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TLDC2A0PJX2 215 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF195O14628 629 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 CLOCKO15516 846 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 PEX11AO75192 247 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ALDH3A1P30838 453 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 LCN1P31025 176 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 HPCAL1P37235 193 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 PPP2R2BQ00005 443 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TP53BP2Q13625 1128 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 CDC73Q6P1J9 531 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 CNPY4Q8N129 248 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF611Q8N823 705 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF614Q8N883 585 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 RNF128Q8TEB7 428 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 MTERF3Q96E29 417 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 MDFIQ99750 246 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 C1orf50Q9BV19 199 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 PIGUQ9H490 435 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TIGARQ9NQ88 270 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 JMJD1CQ15652 2540 aa14.92□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.91□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 P2RX1P51575 399 aa14.91□□□□□ -0.02
TNNT1-201ENST00000291901 TNK1Q13470 666 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms