RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 TCP10LQ8TDR4 215 aa10.67□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 DUSP19Q8WTR2 217 aa10.67□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 TM4SF18Q96CE8 201 aa10.67□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 VSTM2LQ96N03 204 aa10.67□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 ZNF681Q96N22 645 aa10.67□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 FRG2BQ96QU4 278 aa10.67□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 MYLK2Q9H1R3 596 aa10.67□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 DCLRE1BQ9H816 532 aa10.67□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 TAS2R9Q9NYW1 312 aa10.67□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 KCNS2Q9ULS6 477 aa10.67□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 LRRC42Q9Y546 428 aa10.67□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 CCDC189A1A4V9 331 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 DPRXA6NFQ7 191 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 COPEO14579 308 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 IGHV4-31P0DP07 118 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 SERPINB4P48594 390 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 GZMKP49863 264 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 DUSP2Q05923 314 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 C17orf67Q0P5P2 114 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 DLG1Q12959 904 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 CYP27C1Q4G0S4 372 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 ZNF628Q5EBL2 1059 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 PDSS1Q5T2R2 415 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 COMMD6Q7Z4G1 85 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 ZNF619Q8N2I2 560 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 FAM168AQ92567 244 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 PROX1Q92786 737 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 C1orf21Q9H246 121 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 UTS2RQ9UKP6 389 aa10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 A0A1W2PPM1 405 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 ADAMDEC1O15204 470 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 CXCL13O43927 109 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 SPAG7O75391 227 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 ANP32DO95626 131 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 T-ENOLP0DO92 83 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 ZNF17P17021 662 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 USF1P22415 310 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 AGTR1P30556 359 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 ARFIP2P53365 341 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 P2RY6Q15077 328 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 TSC22D1Q15714 1073 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 FAM83EQ2M2I3 478 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 TMEM44Q2T9K0 475 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 TMEM201Q5SNT2 666 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 FAM120AOSQ5T036 256 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 GRTP1Q5TC63 336 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 FAM166AQ6J272 317 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 MFSD12Q6NUT3 480 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 FAM180BQ6P0A1 224 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 NPSR1Q6W5P4 371 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 SSX8Q7RTT4 187 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 C4orf33Q8N1A6 199 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 GABRG1Q8N1C3 465 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 OR4N2Q8NGD1 307 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 KAT2AQ92830 837 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 NXNL1Q96CM4 212 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 NSL1Q96IY1 281 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 RADILQ96JH8 1075 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 BTBD10Q9BSF8 475 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 CACNG6Q9BXT2 260 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 POTEKPQ9BYX7 375 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 ANKRA2Q9H9E1 313 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 HHATLQ9HCP6 504 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 NMRK1Q9NWW6 199 aa10.65□□□□□ -0.7
SPC25-201ENST00000282074 NDUFB5O43674 189 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 PLOD3O60568 738 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 RAMP1O60894 148 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 NME6O75414 186 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 ESRRBO95718 433 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 CSF3P09919 207 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 CDH11P55287 796 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 C21orf58P58505 322 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 RAC1P63000 192 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 IRF9Q00978 393 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 ITGADQ13349 1161 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 DECR1Q16698 335 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 DNAL1Q4LDG9 190 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 SH2D4BQ5SQS7 431 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 HBMQ6B0K9 141 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 C12orf54Q6X4T0 127 aa10.65□□□□□ -0.71
SPC25-201ENST00000282074 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms