RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TMEM43Q9BTV4 400 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 NOX1Q9Y5S8 564 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ALG5Q9Y673 324 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 H0YC42 278 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 GPRIN2O60269 458 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PDX1P52945 283 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 IFITM3Q01628 133 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 C2orf27AQ580R0 203 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RDH10Q8IZV5 341 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 OR5M3Q8NGP4 307 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ASB16Q96NS5 453 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 KATNB1Q9BVA0 655 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ABCG4Q9H172 646 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 KLHL31Q9H511 634 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SCAMP1O15126 338 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RFPL3O75679 317 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R3DO95685 299 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CSF3P09919 207 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ACSM1Q08AH1 577 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CCINQ13939 588 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SLC6A19Q695T7 634 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 KRT77Q7Z794 578 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 OR2A1Q8NGT9 310 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 OR51A7Q8NH64 312 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 UBQLN3Q9H347 655 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 HRASLS2Q9NWW9 162 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 EMC3Q9P0I2 261 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SCDO00767 359 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PRAMEF2O60811 474 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ERGP11308 486 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ID2Q02363 134 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ALG10BQ5I7T1 473 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LIN54Q6MZP7 749 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ULK3Q6PHR2 472 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 C12orf40Q86WS4 652 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ZNF547Q8IVP9 402 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 KXD1Q9BQD3 176 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SLC23A2Q9UGH3 650 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 FFAR1O14842 300 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 KRT33AO76009 404 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LCN1P31025 176 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RAB38P57729 211 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 GALEQ14376 348 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MPEG1Q2M385 716 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 POGLUT1Q8NBL1 392 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CCDC107Q8WV48 283 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SLC35A4Q96G79 324 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 A0A087WV62 115 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PRG6 482 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SGK494L7N484 410 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 UCHL1P09936 223 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MNDAP41218 407 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RABIFP47224 123 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 EVX1P49640 407 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PAQR6Q6TCH4 344 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 OR4N5Q8IXE1 308 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CMIPQ8IY22 773 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.24□□□□□ -1.09
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