RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 ADAM10O14672 748 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 C1QL1O75973 258 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINA1P01009 418 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 IL7RP16871 459 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 CNR1P21554 472 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 MEOX1P50221 254 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 FGFBP1Q14512 234 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 CYBRD1Q53TN4 286 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF311Q5JNZ3 666 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 TBCELQ5QJ74 424 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 CBLL1Q75N03 491 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 SULF2Q8IWU5 870 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 EID3Q8N140 333 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 PQLC1Q8N2U9 271 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 CANT1Q8WVQ1 401 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 RASSF5Q8WWW0 418 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 RNF145Q96MT1 663 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 OLAHQ9NV23 265 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 HEATR5AQ86XA9 2040 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 PRAMEF25A6NGN4 478 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 SERINC4A6NH21 518 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM229AB2RXF0 380 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 NID1P14543 1247 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 HPGDP15428 266 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 CD247P20963 164 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 PRKAR1BP31321 381 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 PTGDSP41222 190 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 KCNJ5P48544 419 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 PMP22Q01453 160 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 LIN52Q52LA3 116 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 FNDC7Q5VTL7 733 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 FAM180AQ6UWF9 173 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF836Q6ZNA1 936 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF614Q8N883 585 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 SMYD1Q8NB12 490 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 NTNG2Q96CW9 530 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 FAM173AQ9BQD7 235 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 PINK1Q9BXM7 581 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 UGT2B28Q9BY64 529 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 DEPPQ9NTK1 212 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 KLRF1Q9NZS2 232 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 RPS6KA6Q9UK32 745 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF232Q9UNY5 417 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 AURKCQ9UQB9 309 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 CHST2Q9Y4C5 530 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 PCNX3Q9H6A9 2034 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 SUV39H1O43463 412 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 TPST1O60507 370 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 ADH7P40394 386 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 CASP3P42574 277 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 DNASE1L1P49184 302 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 CLK3P49761 638 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 SELENOWP63302 87 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 KCNJ10P78508 379 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 SNTA1Q13424 505 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 DUSP7Q16829 419 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 RNF220Q5VTB9 566 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 BICRALQ6AI39 1079 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 ADGRG5Q8IZF4 528 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 OR2M7Q8NG81 312 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 GPR32P1Q8NGA4 272 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 DOHHQ9BU89 302 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 OSBPL11Q9BXB4 747 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 RTN4RQ9BZR6 473 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 VCX3BQ9H321 246 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 ADPRHL2Q9NX46 363 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0G2JMM0 328 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1W2PPB8 328 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1W2PRS3 328 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD33BA6NCL7 494 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 CLDN24A6NM45 220 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 KIR3DP1A8MWS1 328 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 FCGR1AP12314 374 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 GAS1P54826 345 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 MLLT10P55197 1068 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 PLGLB1Q02325 96 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 CD226Q15762 336 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 MARCH3Q86UD3 253 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 CMIPQ8IY22 773 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 SLCO4A1Q96BD0 722 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 FRMD6Q96NE9 622 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 ANGPTL4Q9BY76 406 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 YY1AP1Q9H869 796 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD11-201ENST00000249504 BAG5Q9UL15 447 aa17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms