RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 MVDP53602 400 aa9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 TCTN3Q6NUS6 607 aa9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 TTLL10Q6ZVT0 673 aa9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF563Q8TA94 476 aa9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PSMA8Q8TAA3 256 aa9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 HIST1H2ACQ93077 130 aa9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF559Q9BR84 538 aa9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.9□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 FRS3O43559 492 aa9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 SEC14L2O76054 403 aa9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 IGHV4-34P06331 123 aa9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 CDK1P06493 297 aa9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 IL12BP29460 328 aa9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 MENTQ9BUN1 341 aa9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 FAM117AQ9C073 453 aa9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 DUSP22Q9NRW4 184 aa9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 GPATCH2Q9NW75 528 aa9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 WNT16Q9UBV4 365 aa9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 ENPP5Q9UJA9 477 aa9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 NOX1Q9Y5S8 564 aa9.9□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 SH3PXD2BA1X283 911 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC182A6NF36 153 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 CHRM4P08173 479 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 ENTPD1P49961 510 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 TEKQ02763 1124 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 C14orf28Q4W4Y0 310 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 TPRG1LQ5T0D9 272 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 POMGNT2Q8NAT1 580 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 OR2T33Q8NG76 320 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 OR7G2Q8NG99 324 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 RLIMQ9NVW2 624 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 FUOMA2VDF0 154 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 LILRA5A6NI73 299 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHGA12O60330 932 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 CSF2P04141 144 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 CAPZBP47756 277 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 CDH11P55287 796 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 SLC35A2P78381 396 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 ZFP69Q49AA0 526 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 FCRL6Q6DN72 434 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 KLHL17Q6TDP4 642 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 RTL4Q6ZR62 310 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 STACQ99469 402 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 ACOT13Q9NPJ3 140 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 A0A087WV62 115 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 SCDO00767 359 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 RAB36O95755 333 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 C1QCP02747 245 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 FBLP22087 321 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 HMGA2P52926 109 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 PDX1P52945 283 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 NRMQ8IXM6 262 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 LRR1Q96L50 414 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 OR8D2Q9GZM6 311 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 DUSP21Q9H596 190 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 LHX9Q9NQ69 397 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 POLE3Q9NRF9 147 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 SLC39A1Q9NY26 324 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa9.89□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 CEP192Q8TEP8 1941 aa9.88□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 UNC119BA6NIH7 251 aa9.88□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 CTNSO60931 367 aa9.88□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 REM1O75628 298 aa9.88□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 TCN2P20062 427 aa9.88□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.88□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 CCNJQ5T5M9 372 aa9.88□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 CA13Q8N1Q1 262 aa9.88□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 OR5T3Q8NGG3 340 aa9.88□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 HTRA1Q92743 480 aa9.88□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 SLC35A4Q96G79 324 aa9.88□□□□□ -0.83
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms