RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1Q8VGI1 314 aa15.94■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Thumpd1Q99J36 350 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem269Q9D4Y8 254 aa15.94■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prl8a8Q9DAS4 241 aa15.94■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cpn2Q9DBB9 547 aa15.94■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Snap29Q9ERB0 260 aa15.94■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Klhl1Q9JI74 751 aa15.94■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Alyref2Q9JJW6 218 aa15.94■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Insm2Q9JMC2 493 aa15.94■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ca5bQ9QZA0 317 aa15.94■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CfpP11680 464 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pax7P47239 503 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cry1P97784 606 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Csf2raQ00941 388 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CrxosQ3UL53 246 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hs3st2Q673U1 367 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc22a12Q8CFZ5 553 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Naa10Q9QY36 235 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r31L7N2F1 303 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Psmb5O55234 264 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hoxc5P32043 222 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fam71f1Q3UZD7 341 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Peli2Q8BST6 419 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 4933402N03RikQ8CDT9 329 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 FgbQ8K0E8 481 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tm6sf2Q8R1J1 378 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r228Q8R2A7 333 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ogfrl1Q8VE52 464 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 D6Wsu163eQ91YN0 552 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cers4Q9D6J1 393 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tnfsf13Q9D777 241 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bin3Q9JI08 253 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cd300ld4A2A7W1 245 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm20547B8JJN0 1276 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CfbP04186 761 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P04213 122 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cdk1P11440 297 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ArsaP50428 506 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Opn1swP51491 346 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Secisbp2Q3U1C4 858 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pon3Q62087 354 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cd300ld3Q6SJQ5 245 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trmt6Q8CE96 497 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Adamts8P57110 905 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dcdc2Q5DU00 475 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rpa2Q62193 270 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 BpiQ67E05 483 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Calm5Q6W3E0 140 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hs6st2Q80UW0 612 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cdkn3Q810P3 211 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mab21l2Q8BPP1 359 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Stk-ps2Q8C0V7 499 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Znf628Q8CJ78 1038 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cd276Q8VE98 316 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Papd4Q91YI6 484 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mrgprb3Q91ZC1 312 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Wdr6Q99ME2 1125 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lrrc18Q9CQ07 262 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dhrs7Q9CXR1 338 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 LhppQ9D7I5 270 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dnajb8Q9QYI7 227 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Syt8Q9R0N6 395 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ProdhQ9WU79 599 aa15.93■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trbv20A0A0B4J1H5 111 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 4930595M18RikA2RRY9 829 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r92L7N2A4 860 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sh3yl1O08641 340 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Acvr1P37172 509 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PrtgQ2EY15 1191 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zik1Q80YP6 463 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q8BHR8 331 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Eif4e2Q8BMB3 245 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc25a46Q9CQS4 418 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 HnrnpfQ9Z2X1 415 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm1110F6Y113 635 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc16a5G5E8K6 468 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r109K7N747 858 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1513L7N457 313 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rbbp9O88851 186 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 mt-Co3P00416 261 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cfl1P18760 166 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ankub1Q3UUE9 192 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cldn34b4Q3V0X2 211 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mfsd13aQ6PDE8 519 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr270Q7TS19 314 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc30a6Q8BJM5 460 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem163Q8C996 288 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sphk1Q8CI15 382 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rbm48Q8K2X2 371 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1312Q8VF10 317 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr539Q8VGL9 319 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr575Q8VH16 318 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fmo4Q8VHG0 560 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Wdr45bQ9CR39 344 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccdc167Q9D162 97 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r99H3BK37 856 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cdh10P70408 788 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 HgfQ08048 728 aa15.92■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pdss2Q33DR3 401 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.3 ms