RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdc26Q99JP4 85 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dhrs1Q99L04 313 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rsl24d1Q99L28 163 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Eif2b1Q99LC8 305 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CygbQ9CX80 190 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pinx1Q9CZX5 332 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lsm12Q9D0R8 195 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmbim6Q9D2C7 237 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fndc8Q9D2H8 321 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ankrd22Q9D3J5 191 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NtsQ9D3P9 169 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Armc1Q9D7A8 282 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mcemp1Q9D8U6 183 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gtf2e2Q9D902 292 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc13a2Q9ES88 586 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pik3cgQ9JHG7 1102 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mpp5Q9JLB2 675 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Spo11Q9WTK8 396 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Thbs4Q9Z1T2 963 aa4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Keap1Q9Z2X8 624 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prrc2aQ7TSC1 2158 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tenm2Q9WTS5 2764 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm14399A2ARW8 610 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zmynd12A2BGJ5 363 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Serpinb3cA2RSF9 386 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zar1lC3VD30 291 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Chst13D3Z6E3 336 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm16494E9Q2Z4 87 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ceacam3E9Q6J4 706 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm2832F7AEC7 200 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rundc3aO08576 446 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sh3yl1O08641 340 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fkbp7O54998 218 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Aif1O70200 147 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pias1O88907 651 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P01668 110 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P01673 111 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 JunP05627 334 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wnt3P17553 355 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Il1rnP25085 178 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fen1P39749 378 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Id2P41136 134 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Drd4P51436 387 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cyp2a12P56593 492 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pdcd5P56812 126 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fgf1P61148 155 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Psme3P61290 254 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atp6v1b2P62814 511 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ldb1P70662 411 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AnpepP97449 966 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NrtnP97463 195 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 G6pdxQ00612 515 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbp1Q00915 135 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Glycam1Q02596 151 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mmp11Q02853 492 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ptpn2Q06180 406 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fezf1Q0VDQ9 475 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MamstrQ0ZCJ7 421 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nat9Q3UG98 241 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 StradaQ3UUJ4 431 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdk15Q3V3A1 433 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc22a16Q497L8 649 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab26Q504M8 260 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ankrd13bQ5F259 626 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tnfaip3Q60769 775 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tob1Q61471 362 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 WdcpQ6NV72 663 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 IppkQ6P1C1 489 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rundc3bQ6PDC0 408 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SvoplQ6PDF3 494 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kirrel1Q80W68 789 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trim50Q810I2 483 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pld4Q8BG07 503 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pex26Q8BGI5 305 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lyve1Q8BHC0 318 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smyd4Q8BTK5 799 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kyat1Q8BTY1 424 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cndp1Q8BUG2 492 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp398Q8BV16 643 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Clic5Q8BXK9 251 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Peli3Q8BXR6 445 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Poglut1Q8BYB9 392 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lacc1Q8BZT9 430 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpat3Q8C0N2 438 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem252Q8C353 183 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem154Q8C4Q9 181 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bhlhe22Q8C6A8 355 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccm2Q8K2Y9 453 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adam32Q8K410 754 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BfarQ8R079 450 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tm6sf2Q8R1J1 378 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ubqln1Q8R317 582 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ntng2Q8R4F1 589 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vps39Q8R5L3 886 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 FggQ8VCM7 436 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klrb1fQ8VD98 217 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Duoxa1Q8VE49 341 aa4.93□□□□□ -1.62
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1090Q8VGA6 313 aa4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.6 ms