RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SLC35A4Q96G79 324 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM19Q96HH6 336 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 COL21A1Q96P44 957 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SDF2Q99470 211 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 TRIM4Q9C037 500 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SELENONQ9NZV5 590 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 CNIH4Q9P003 139 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 MYOTQ9UBF9 498 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 POLHQ9Y253 713 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 PTPRBP23467 1997 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SDK2Q58EX2 2172 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 NINQ8N4C6 2090 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1W2PQD3 144 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 GNGT2O14610 69 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 KIAA0513O60268 411 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 REM1O75628 298 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 KCNK2O95069 426 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 H6PDO95479 791 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 LDLRP01130 860 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 UMODP07911 640 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 CT45A8P0DMV1 189 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 CT45A9P0DMV2 189 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 COX6A1P12074 109 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 RHCEP18577 417 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 TBXA2RP21731 343 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 COPZ1P61923 177 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 PSG6Q00889 435 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 CHAF1BQ13112 559 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SELPLGQ14242 412 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 PCOLCEQ15113 449 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF141Q15928 474 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.75□□□□□ -1.33
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SMAD4-210ENST00000590061 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM81Q6P7N7 255 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SVOPLQ8N434 492 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 CDS1Q92903 461 aa6.75□□□□□ -1.33
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SMAD4-210ENST00000590061 UCN3Q969E3 161 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.75□□□□□ -1.33
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SMAD4-210ENST00000590061 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 LMF1Q96S06 567 aa6.75□□□□□ -1.33
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SMAD4-210ENST00000590061 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 LHPPQ9H008 270 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 S100A14Q9HCY8 104 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 AURKCQ9UQB9 309 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 FAM149AA5PLN7 773 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.74□□□□□ -1.33
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