RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586039.1

PKN1-205, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 2

Gene PKN1, Length 686 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-205	ENST00000586039	FAM157A	C9JC47	383 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039		E7EQL1	145 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039		G3V2L1	256 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CLDN9	O95484	217 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CBX7	O95931	251 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	PROC	P04070	461 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	KRT4	P19013	534 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	PNLIPRP2	P54317	469 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	PSPH	P78330	225 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	ITGAD	Q13349	1161 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	P2RY6	Q15077	328 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	PPA1	Q15181	289 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	LIPJ	Q5W064	366 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	OR10D3	Q8NH80	312 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	MUCL1	Q96DR8	90 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	HBEGF	Q99075	208 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	SPAG7	O75391	227 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	SUPT7L	O94864	414 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	OR4F21	O95013	312 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	ADA	P00813	363 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	ATP1B1	P05026	303 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	EVI2B	P34910	448 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	EMD	P50402	254 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	FABP6	P51161	128 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CLC	Q05315	142 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CUL3	Q13618	768 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	STK11	Q15831	433 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	SSX8	Q7RTT4	187 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	GALNT10	Q86SR1	603 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039		H0YIV9	168 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	PLIN3	O60664	434 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	LY6H	O94772	140 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	NUDT17	P0C025	328 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CHN1	P15882	459 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	TAC1	P20366	129 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	PRKAA2	P54646	552 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CHRNB3	Q05901	458 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	STX5	Q13190	355 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	EMB	Q6PCB8	327 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	SLC22A25	Q6T423	547 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039		Q6ZSR9	355 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	BTBD9	Q96Q07	612 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	KCNA7	Q96RP8	456 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	TMCO1	Q9UM00	188 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	FKBP7	Q9Y680	259 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	COPE	O14579	308 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CXCL13	O43927	109 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	GLRA3	O75311	464 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	NTN1	O95631	604 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	PDYN	P01213	254 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	GSTA1	P08263	222 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CT45A8	P0DMV1	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CT45A9	P0DMV2	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	ZNF23	P17027	643 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	IMPDH1	P20839	514 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CRHR1	P34998	444 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	HTR6	P50406	440 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	SLC18A2	Q05940	514 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	MIDN	Q504T8	468 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	CCDC63	Q8NA47	563 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	TIMM22	Q9Y584	194 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-205	ENST00000586039	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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