RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 NTMQ9P121 344 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GPR52Q9Y2T5 361 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 A0A0J9YW62 118 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 C7orf72A4D263 438 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SCDO00767 359 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 AZIN1O14977 448 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 KLF4O43474 513 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TBX19O60806 448 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TMCC2O75069 709 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SOX30O94993 753 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 KCNK2O95069 426 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 THBDP07204 575 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 LINC00032P0C843 101 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ACP2P11117 423 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 NEFHP12036 1026 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CCKARP32238 428 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 EIF1P41567 113 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ASMTP46597 345 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PRIM2P49643 509 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PPP2R2BQ00005 443 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SLC18A2Q05940 514 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 LIPMQ5VYY2 423 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 Q6ZSR9 355 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 LILRA2Q8N149 483 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 COX18Q8N8Q8 333 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GATSQ8NAP1 163 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ZNF527Q8NB42 609 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 FBXO30Q8TB52 745 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 MTERF3Q96E29 417 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GIMAP5Q96F15 307 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CHMP6Q96FZ7 201 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 C16orf58Q96GQ5 468 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 RNF145Q96MT1 663 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 MS4A4EQ96PG1 132 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TSSK3Q96PN8 268 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TRMOQ9BU70 441 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 BTBD2Q9BX70 525 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TXLNGYQ9BZA5 131 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GSX2Q9BZM3 304 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 HOXD1Q9GZZ0 328 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 OR10A4Q9H209 315 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PPCSQ9HAB8 311 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 FIS1Q9Y3D6 152 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 JMJD1CQ15652 2540 aa7.3□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ARID1AO14497 2285 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PQD3 144 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TRIM64BA6NI03 449 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SMIM23A6NLE4 172 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GJE1A6NN92 205 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TMEM114B3SHH9 223 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 H3BNH8 94 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TNFSF11O14788 317 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 HS3ST1O14792 307 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TRIM13O60858 407 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PRKD3O94806 890 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 NUDT14O95848 222 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TUBBP07437 444 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 FGF4P08620 206 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PAX1P15863 534 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SDC1P18827 310 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 KRT4P19013 534 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ATP6V1C1P21283 382 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 MAPK1P28482 360 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PTH2RP49190 550 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 RPL38P63173 70 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PDE7AQ13946 482 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 DUSP5Q16690 384 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GALNTL6Q49A17 601 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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