RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555912.1

PAPOLA-217, Transcript of poly(A) polymerase alpha, humanhuman

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 2,277 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLA-217ENST00000555912 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 WDR88Q6ZMY6 472 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 FGF11Q92914 225 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 RFKQ969G6 155 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 CEP19Q96LK0 163 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 CD180Q99467 661 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 STUB1Q9UNE7 303 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.56□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 IRGMA1A4Y4 181 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 HYKKA2RU49 373 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 FUOMA2VDF0 154 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 CTDSP2O14595 271 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 RGS5O15539 181 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 TBX1O43435 398 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 KLF4O43474 513 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 FOXS1O43638 330 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 CTNSO60931 367 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 NKX2-2O95096 273 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 HMGN1P05114 100 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 SAGP10523 405 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 BMP7P18075 431 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 MAKP20794 623 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 MAOAP21397 527 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 CRYBB2P43320 205 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 CAPZBP47756 277 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 SEPHS1P49903 392 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 LIMK1P53667 647 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 GFERP55789 205 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 WNT4P56705 351 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 SKP1P63208 163 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 PSG6Q00889 435 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 MXD1Q05195 221 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 C3orf38Q5JPI3 329 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 RNLSQ5VYX0 342 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 MRGPREQ86SM8 312 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 CPOQ8IVL8 374 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 OR4F15Q8NGB8 312 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 DGAT2Q96PD7 388 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 MROQ9BYG7 248 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 FOXQ1Q9C009 403 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 RACGAP1Q9H0H5 632 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 OR52D1Q9H346 318 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 UBQLN3Q9H347 655 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 FOLH1BQ9HBA9 442 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 KRBA1A5PL33 1030 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 TAF4O00268 1085 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 S1PR1P21453 382 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 CD40LGP29965 261 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 MAP3K8P41279 467 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 EMDP50402 254 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 GAS1P54826 345 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 OXA1LQ15070 435 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 C22orf42Q6IC83 251 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 GATAD2AQ86YP4 633 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 OR51A7Q8NH64 312 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 FANK1Q8TC84 345 aa7.55□□□□□ -1.2
PAPOLA-217ENST00000555912 BPIFA2Q96DR5 249 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms