RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	STK32C	Q86UX6	486 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	LCA5	Q86VQ0	697 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	ABHD3	Q8WU67	409 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	OR10A4	Q9H209	315 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	FANCF	Q9NPI8	374 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	GLRX2	Q9NS18	164 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	EMCN	Q9ULC0	261 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61	9e-7	■■■□□ 18.1
LETMD1-231	ENST00000551931	TTC36	A6NLP5	189 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931		G3V2L1	256 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CLOCK	O15516	846 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PDPK1	O15530	556 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNK2	O95069	426 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	DANCR	P0C864	163 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	GPC1	P35052	558 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	SFTPD	P35247	375 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CDKN1A	P38936	164 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PRKAG1	P54619	331 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	KIAA0040	Q15053	153 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	TAB1	Q15750	504 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CD226	Q15762	336 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	DUSP5	Q16690	384 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM110B	Q8TC76	370 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF128	Q8TEB7	428 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	OSTF1	Q92882	214 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXW5	Q969U6	566 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	KLHL15	Q96M94	604 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	REG4	Q9BYZ8	158 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	EFNA2	O43921	213 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ABHD2	P08910	425 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	LINGO3	P0C6S8	592 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ME2	P23368	584 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ACVR1B	P36896	505 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PRIM2	P49643	509 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXF1	Q12946	379 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	SZRD1	Q7Z422	152 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	TRABD2A	Q86V40	505 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	LILRA2	Q8N149	483 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	NUP43	Q8NFH3	380 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	MZB1	Q8WU39	189 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	NTM	Q9P121	344 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	LIPT1	Q9Y234	373 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62	4e-11	■■■■□ 22.8
LETMD1-231	ENST00000551931	OIP5	O43482	229 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	AKAP10	O43572	662 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	NDUFS7	O75251	213 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	SEC22B	O75396	215 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	IGHV4-39	P01824	125 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CD3E	P07766	207 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	THBS1	P07996	1170 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	GSTA1	P08263	222 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	MYL2	P10916	166 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	SDC1	P18827	310 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PRPH2	P23942	346 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CARD18	P57730	90 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ETFDH	Q16134	617 aa		11.18	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms