RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551920.1

GCN1-209, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

TSL 3

Gene GCN1, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-209ENST00000551920 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.85□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 EXO5Q9H790 373 aa14.85□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 POLE3Q9NRF9 147 aa14.85□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.85□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.85□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.85□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 DTNAQ9Y4J8 743 aa14.85□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.85□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 CLDN24A6NM45 220 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 LDLRP01130 860 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 BCHEP06276 602 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 TFPTP0C1Z6 253 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 NHSL2Q5HYW2 709 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 ZNF527Q8NB42 609 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 OR14L1PQ8NHC6 308 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 MAL2Q969L2 176 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 ZNF524Q96C55 264 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 P2RX2Q9UBL9 471 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 LIPT1Q9Y234 373 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.84□□□□□ -0.03
GCN1-209ENST00000551920 SERINC4A6NH21 518 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 CCL21O00585 134 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 PRRG2O14669 202 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 BCKDKO14874 412 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 HCRTR2O43614 444 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 AGFG2O95081 481 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 NR2F1P10589 423 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 BMP7P18075 431 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 MTPNP58546 118 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 HPCAP84074 193 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 FADDQ13158 208 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 SKP2Q13309 424 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 NFYCQ13952 458 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 TMEM44Q2T9K0 475 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 GXYLT1Q4G148 440 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 REP15Q6BDI9 236 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 VASNQ6EMK4 673 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 IFNEQ86WN2 208 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 TREML1Q86YW5 311 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 MISPQ8IVT2 679 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 SARAFQ96BY9 339 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 CGREF1Q99674 301 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 TIMP4Q99727 224 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 MRGBPQ9NV56 204 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 CARD8Q9Y2G2 431 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 MEMO1Q9Y316 297 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 FAM215AQ9Y5M1 114 aa14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 DNAJC13O75165 2243 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 A0A1B0GUH1 482 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 WIPF3A6NGB9 483 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 AGAP5A6NIR3 686 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 SLC22A2O15244 555 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 UBL4AP11441 157 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 GPX2P18283 190 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 HK1P19367 917 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 FGFBP1Q14512 234 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 PLPPR5Q32ZL2 321 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 RAET1LQ5VY80 246 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 RTL6Q6ICC9 239 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 POU5F2Q8N7G0 328 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 CCDC120Q96HB5 630 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 TMEM19Q96HH6 336 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 SFXN2Q96NB2 322 aa14.82□□□□□ -0.04
GCN1-209ENST00000551920 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms