RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534382.5

CTSB-231, Transcript of cathepsin B, human

TSL 4

Gene CTSB, Length 764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSB-231	ENST00000534382	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	RCAN2	Q14206	197 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	GPR68	Q15743	365 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	BCL2A1	Q16548	175 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ARSK	Q6UWY0	536 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	LACC1	Q8IV20	430 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	RAB8B	Q92930	207 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	VPS33A	Q96AX1	596 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	TRIB1	Q96RU8	372 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	CALHM2	Q9HA72	323 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382		Q9UFV3	132 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382		A0A087WZY1	265 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	OR2M5	A3KFT3	312 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	CD8B2	A6NJW9	211 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382		H0Y3Z8	333 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	HMGN4	O00479	90 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ATP8B1	O43520	1251 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	HCRTR2	O43614	444 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	TOX	O94900	526 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ANP32D	O95626	131 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	KRT75	O95678	551 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	PEPD	P12955	493 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF708	P17019	499 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ATP4B	P51164	291 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	CLDN18	P56856	261 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF141	Q15928	474 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	HSPB2	Q16082	182 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF614	Q8N883	585 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ZFP90	Q8TF47	636 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ROPN1L	Q96C74	230 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	NPHS2	Q9NP85	383 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	POLE3	Q9NRF9	147 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	MKLN1	Q9UL63	735 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	VDAC3	Q9Y277	283 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	IL2RA	P01589	272 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	MAGEA8	P43361	318 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	P2RX1	P51575	399 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF117	Q03924	483 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	FUT5	Q11128	374 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	SQLE	Q14534	574 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	COX20	Q5RI15	118 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	CBLN3	Q6UW01	205 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	GTF2H4	Q92759	462 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	UCN2	Q96RP3	112 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	UCK2	Q9BZX2	261 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	MED17	Q9NVC6	651 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	LIPT1	Q9Y234	373 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	WDR45	Q9Y484	360 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		13.11	□□□□□ -0.31

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