RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 NOTUMQ6P988 496 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 IYDQ6PHW0 289 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CNSTQ6PJW8 725 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CLEC20AQ6ZU45 233 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 PAQR9Q6ZVX9 377 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CDK20Q8IZL9 346 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 EID3Q8N140 333 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 DNAAF3Q8N9W5 541 aa3.81□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CCNYQ8ND76 341 aa3.81□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 CCDC107Q8WV48 283 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 SEPT8Q92599 483 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 LPGAT1Q92604 370 aa3.81□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 C10orf90Q96M02 699 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 NECTIN4Q96NY8 510 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TBL1YQ9BQ87 522 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 C9orf16Q9BUW7 83 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 FNDC11Q9BVV2 318 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ULBP1Q9BZM6 244 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 SNX25Q9H3E2 840 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 DPAGT1Q9H3H5 408 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 POMKQ9H5K3 350 aa3.81□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa3.81□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 ACTR3BQ9P1U1 418 aa3.81□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 ZNF639Q9UID6 485 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ACOT9Q9Y305 439 aa3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TANC1Q9C0D5 1861 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 DHRS12A0PJE2 317 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CCDC160A6NGH7 325 aa3.8□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 RFC2P35250 354 aa3.8□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 BRMS1LQ5PSV4 323 aa3.8□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 SYPL2Q5VXT5 272 aa3.8□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 TMEM86AQ8N2M4 240 aa3.8□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 ATPAF2Q8N5M1 289 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TRIML2Q8N7C3 387 aa3.8□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 LEMD2Q8NC56 503 aa3.8□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa3.8□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 AGR3Q8TD06 166 aa3.8□□□□□ -1.8
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