RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494945.1

PKP4-215, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 5

Gene PKP4, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-215	ENST00000494945	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ACER3	Q9NUN7	267 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	RLIM	Q9NVW2	624 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	USE1	Q9NZ43	259 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	AK5	Q9Y6K8	562 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945		U3KQV3	271 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	EI24	O14681	340 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	FFAR1	O14842	300 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	FRS3	O43559	492 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ICOSLG	O75144	302 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	UGT2B11	O75310	529 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	SEMA7A	O75326	666 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	OR5F1	O95221	314 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	CSTA	P01040	98 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	SERPINA7	P05543	415 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	FBXO45	P0C2W1	286 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	LIMS1	P48059	325 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ALDH3A2	P51648	485 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF136	P52737	540 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	AQP4	P55087	323 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	TAS2R41	P59536	307 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	AMER2	Q8N7J2	671 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	TTC9	Q92623	222 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF597	Q96LX8	424 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	PSD2	Q9BQI7	771 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF559	Q9BR84	538 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	IL17B	Q9UHF5	180 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	LRRC42	Q9Y546	428 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945		A0A1W2PRQ8	180 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ALG1L2	C9J202	215 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	FAAH	O00519	579 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF264	O43296	627 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	FADS1	O60427	444 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	TPST2	O60704	377 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ITGA10	O75578	1167 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	OR2J2	O76002	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ALPL	P05186	524 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	CELA2A	P08217	269 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	THRB	P10828	461 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	UBL4A	P11441	157 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	LIF	P15018	202 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	EVI2B	P34910	448 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	PPP2R2B	Q00005	443 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	PLAUR	Q03405	335 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ST3GAL3	Q11203	375 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ATP1A4	Q13733	1029 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	DGCR6	Q14129	220 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	TRAM2	Q15035	370 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	NTRK2	Q16620	822 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	MICA	Q29983	383 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	OPN5	Q6U736	354 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	LYPD8	Q6UX82	237 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	MISP	Q8IVT2	679 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	LINC00471	Q8N535	108 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	SLC5A8	Q8N695	610 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	OR52J3	Q8NH60	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	GIPC3	Q8TF64	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	RNF138	Q8WVD3	245 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKP4-215	ENST00000494945	HGD	Q93099	445 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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