RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 UQCRC1P31930 480 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MPIP34949 423 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 AHRP35869 848 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FASLGP48023 281 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CSNK2BP67870 215 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GPLD1P80108 840 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ABATP80404 500 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 C1orf61Q13536 156 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DOC2BQ14184 412 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 HLA-BQ31612 363 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF425Q6IV72 752 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MCFD2Q8NI22 146 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR7D2Q96RA2 312 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GPA33Q99795 319 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 EHD3Q9NZN3 535 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 KLF15Q9UIH9 416 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 WIPF3A6NGB9 483 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ADAP00813 363 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FHP07954 510 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NR2F6P10588 404 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 BMP4P12644 408 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CPN2P22792 545 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MMP11P24347 488 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CD38P28907 300 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RFX3P48380 749 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PDX1P52945 283 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GPR85P60893 370 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MAP4K2Q12851 820 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GPR18Q14330 331 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NFATC4Q14934 902 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ASPGQ86U10 573 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLC34A3Q8N130 599 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ELP4Q96EB1 424 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 Q96MT0 163 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR6C2Q9NZP2 312 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 VCANP13611 3396 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SPEGQ15772 3267 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.52□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LMO7DNF2Z398 122 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ARHGEF9O43307 516 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LDB3O75112 727 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PAHP00439 452 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CASP3P42574 277 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SERPINB10P48595 397 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PRR5P85299 388 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RGS1Q08116 209 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TGM3Q08188 693 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GINS1Q14691 196 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZMYND11Q15326 602 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ALG11Q2TAA5 492 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CCNJQ5T5M9 372 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MLIPQ5VWP3 458 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CORO6Q6QEF8 472 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZSR6 202 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PAQR7Q86WK9 346 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.52□□□□□ -1.37
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