RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD34CP0C6C1 535 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 DHCR24Q15392 516 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 UXS1Q8NBZ7 420 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 OR51G2Q8NGK0 314 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 C16orf78Q8WTQ4 265 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RSPRY1Q96DX4 576 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 DPYSL5Q9BPU6 564 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FAM83CQ9BQN1 747 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ISYNA1Q9NPH2 558 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 DMRT3Q9NQL9 472 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TRPC4Q9UBN4 977 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 EYSQ5T1H1 3165 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CBX7O95931 251 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 IL3P08700 152 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 NMBP08949 121 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PTNP21246 168 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A25Q6KCM7 469 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FGD2Q7Z6J4 655 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CACUL1Q86Y37 369 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MEIOBQ8N635 442 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ARRDC3Q96B67 414 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 DTD2Q96FN9 168 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF354BQ96LW1 612 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF607Q96SK3 696 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ABCG4Q9H172 646 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 IFT22Q9H7X7 185 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 C5AR2Q9P296 337 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 DOCK9Q9BZ29 2069 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 A0A0B4J203 849 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RTCAO00442 366 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SIX6O95475 246 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CXCL2P19875 107 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 HSD3B2P26439 372 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 VIPR2P41587 438 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RFX3P48380 749 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 VEGFCP49767 419 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PRMT2P55345 433 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC3A1Q07837 685 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SFXN4Q6P4A7 337 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 Q6ZTK2 550 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 OR56B4Q8NH76 319 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 GANCQ8TET4 914 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC5A11Q8WWX8 675 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PDXPQ96GD0 296 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 C12orf57Q99622 126 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 NPAS1Q99742 590 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC6A17Q9H1V8 727 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 KCNK12Q9HB15 430 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FAM183AA6NL82 134 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 ARPC5O15511 151 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 TIMP1P01033 207 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 CISD3P0C7P0 127 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 DRD2P14416 443 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 NPR2P20594 1047 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 CDK5Q00535 292 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 ETFDHQ16134 617 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 ZNF454Q8N9F8 522 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 FUZQ9BT04 418 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 BTBD1Q9H0C5 482 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 ZNF69Q9UC07 566 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 LIPT1Q9Y234 373 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 TRABD2BA6NFA1 517 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 ANXA2P2A6NMY6 339 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 WNT1P04628 370 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 SLC16A1P53985 500 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 CNTN1Q12860 1018 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 GNA13Q14344 377 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 BTN2A1Q7KYR7 527 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 BBS1Q8NFJ9 593 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 OR5AR1Q8NGP9 310 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 RFKQ969G6 155 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 YIPF5Q969M3 257 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 SEC22CQ9BRL7 303 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 NANSQ9NR45 359 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 TM7SF3Q9NS93 570 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 A4GNTQ9UNA3 340 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 CHST2Q9Y4C5 530 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 RNF13O43567 381 aa12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms