RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 UGT2B28Q9BY64 529 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 PCDHAC1Q9H158 963 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 TUBD1Q9UJT1 453 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SLC13A4Q9UKG4 626 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 PCSK5Q92824 1860 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FADS1O60427 444 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 UGT2B11O75310 529 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 OR6B1O95007 311 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SNX4O95219 450 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 MSX1P28360 303 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 RFX3P48380 749 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ACTR3P61158 418 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 C17orf67Q0P5P2 114 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FGFBP1Q14512 234 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SLC22A10Q63ZE4 541 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 IGFL3Q6UXB1 125 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 IL20RBQ6UXL0 311 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 PRR22Q8IZ63 422 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 BEST3Q8N1M1 668 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FAM13CQ8NE31 585 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 OR4C3Q8NH37 302 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 PROX1Q92786 737 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 DOHHQ9BU89 302 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 MAGIXQ9H6Y5 334 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 YY1AP1Q9H869 796 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SH2D2AQ9NP31 389 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FBXO34Q9NWN3 711 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 PACSIN3Q9UKS6 424 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 USP22Q9UPT9 525 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 OR5H15A6NDH6 313 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 PRAMEF25A6NGN4 478 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SERINC4A6NH21 518 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 NDUFB5O43674 189 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ICOSLGO75144 302 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SERPINA1P01009 418 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 P04436 131 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 NCK1P16333 377 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 EVI2BP34910 448 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 KCNJ10P78508 379 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 TUBA3CQ13748 450 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 GRAMD1BQ3KR37 738 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CYBRD1Q53TN4 286 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FCRLBQ6BAA4 426 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 TUBA3EQ6PEY2 450 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ZNF550Q7Z398 422 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SPPL2CQ8IUH8 684 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 POGLUT1Q8NBL1 392 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FDCSPQ8NFU4 85 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 NR4A3Q92570 626 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 TAMM41Q96BW9 452 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 PYURFQ96I23 114 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FRMD6Q96NE9 622 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ANGPTL4Q9BY76 406 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 METTL7AQ9H8H3 244 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SACM1LQ9NTJ5 587 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 LRFN1Q9P244 771 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ABCA12Q86UK0 2595 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 TCRBV5S2A0A599 114 aa10.71□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CDHR4A6H8M9 788 aa10.71□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 A6NL46 340 aa10.71□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 MASP2O00187 686 aa10.71□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 LGI1O95970 557 aa10.71□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CSTAP01040 98 aa10.71□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FESP07332 822 aa10.71□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 UQCRBP14927 111 aa10.71□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CD46P15529 392 aa10.71□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ITGA2P17301 1181 aa10.71□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CD247P20963 164 aa10.71□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CNR1P21554 472 aa10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms