RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 SLC30A2Q9BRI3 323 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 BARHL1Q9BZE3 327 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 ADAP2Q9NPF8 381 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 CBLCQ9ULV8 474 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 LDB3O75112 727 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 S1PR1P21453 382 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 SLC1A3P43003 542 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 FASLGP48023 281 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 GPR50Q13585 617 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 GPR68Q15743 365 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 GARNL3Q5VVW2 1013 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 ARMC6Q6NXE6 501 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM239Q8WW34 195 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 SHDQ96IW2 340 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 PRRX2Q99811 253 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF426Q9BUY5 554 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 BAIAP2Q9UQB8 552 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 NTNG1Q9Y2I2 539 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 BHLHE40O14503 412 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 PIP5K1CO60331 668 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 CT62P0C5K7 136 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 HSDL2Q6YN16 418 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 LNX2Q8N448 690 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 CCDC3Q9BQI4 270 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 IER2Q9BTL4 223 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 PCED1AQ9H1Q7 454 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 INPP5EQ9NRR6 644 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 LILRA5A6NI73 299 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 CDC42EP2O14613 210 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 TSPAN19P0C672 248 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 ZGLP1P0C6A0 271 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 TBXA2RP21731 343 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 GPR4P46093 362 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 PSPHP78330 225 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 BIKQ13323 160 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 TCEA2Q15560 299 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 LIPKQ5VXJ0 399 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 MED25Q71SY5 747 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF595Q8IYB9 648 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 OR5T3Q8NGG3 340 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 TM9SF4Q92544 642 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 LRFN5Q96NI6 719 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 UBQLN3Q9H347 655 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 ASB6Q9NWX5 421 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 NCOR1O75376 2440 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF860A6NHJ4 632 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 SLC30A4O14863 429 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF217O75362 1048 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 KCNK2O95069 426 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 RCBTB2O95199 551 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 CTSEP14091 401 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 HOXC5Q00444 222 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 PLAURQ03405 335 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 FAM53BQ14153 422 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF141Q15928 474 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 CCNJQ5T5M9 372 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 SLC30A6Q6NXT4 461 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 SNX29P2Q8IUI4 249 aa11.32□□□□□ -0.6
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PTPRF-212ENST00000477970 LSMEM1Q8N8F7 131 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 KLHDC7BQ96G42 594 aa11.32□□□□□ -0.6
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PTPRF-212ENST00000477970 CD180Q99467 661 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 LRRC61Q9BV99 259 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 SCN3AQ9NY46 2000 aa11.31□□□□□ -0.6
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PTPRF-212ENST00000477970 A0A1B0GX12 115 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 CHP2O43745 196 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 ST6GAL1P15907 406 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 CAPZA2P47755 286 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 SLC9A3P48764 834 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 FXYD6P3P58550 94 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 DEFA1P59665 94 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 DEFA3P59666 94 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 AMZ1Q400G9 498 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 WDR88Q6ZMY6 472 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 GALNT12Q8IXK2 581 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 KLHL36Q8N4N3 616 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 OR52L1Q8NGH7 329 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 GPR151Q8TDV0 419 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 KCTD7Q96MP8 289 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 KLHL25Q9H0H3 589 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 OR52D1Q9H346 318 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 ABCB10Q9NRK6 738 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 CYP8B1Q9UNU6 501 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRF-212ENST00000477970 TBX1O43435 398 aa11.31□□□□□ -0.6
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