RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461327.5

RRM2-204, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory subunit M2, human

TSL 2

Gene RRM2, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2-204	ENST00000461327	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	PLLP	Q9Y342	182 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	ABCD4	O14678	606 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GMFG	O60234	142 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	ULK1	O75385	1050 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	OPN1LW	P04000	364 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	FES	P07332	822 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	FCGR2A	P12318	317 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	S1PR1	P21453	382 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	ADH6	P28332	368 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	NAA20	P61599	178 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	CARTPT	Q16568	116 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	PROX1	Q92786	737 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	COL21A1	Q96P44	957 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	WDR41	Q9HAD4	459 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	NGB	Q9NPG2	151 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	FANCF	Q9NPI8	374 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	MED11	Q9P086	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	HMOX2	P30519	316 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	MAPK12	P53778	367 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SPOCK1	Q08629	439 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	PCLAF	Q15004	111 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	STK11	Q15831	433 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	LIPM	Q5VYY2	423 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	STK32C	Q86UX6	486 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	TMCO6	Q96DC7	493 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	APIP	Q96GX9	242 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	APOPT1	Q96IL0	206 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	OR10A4	Q9H209	315 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	C1orf226	A1L170	272 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	CPM	P14384	443 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	AGTR1	P30556	359 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	XK	P51811	444 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GAS1	P54826	345 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	DUSP2	Q05923	314 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	MGAT2	Q10469	447 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	PRR31	Q5SQ13	230 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	RINL	Q6ZS11	566 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GGN	Q86UU5	652 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	OR2M3	Q8NG83	312 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF681	Q96N22	645 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	MCM8	Q9UJA3	840 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327		E7EQL1	145 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327		H3BQF6	201 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	TRIM13	O60858	407 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	GUCY1B2	O75343	617 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	SPAG7	O75391	227 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	TTK	P33981	857 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	P2RY6	Q15077	328 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	CCDC63	Q8NA47	563 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	HSD17B8	Q92506	261 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRM2-204	ENST00000461327	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		13.7	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms