RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 SERTAD2Q14140 314 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 NR1D2Q14995 579 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 GAB3Q8WWW8 586 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 DPH1Q9BZG8 443 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 FGF21Q9NSA1 209 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 C20orf141Q9NUB4 165 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D23Q9NUY8 699 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 PILRBQ9UKJ0 227 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 KLF4O43474 513 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 DBTP11182 482 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 DRD5P21918 477 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 DOC2BQ14184 412 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 MED22Q15528 200 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 BCORP1Q8N888 145 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D15Q8TC07 691 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 NLGN3Q9NZ94 848 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 CBLCQ9ULV8 474 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 LYPD3O95274 346 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 NDUFAF6Q330K2 333 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 CARFQ8N187 725 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 FAM26EQ8N5C1 309 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM239Q8WW34 195 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 PMM1Q92871 262 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 IER2Q9BTL4 223 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 CDCA4Q9BXL8 241 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 OR8D2Q9GZM6 311 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 ENTPD1P49961 510 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 FOXL2P58012 376 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 OCLNQ16625 522 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 HLA-BQ31612 363 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 PERM1Q5SV97 790 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 PRSS42Q7Z5A4 293 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 OR2I1PQ8NGU4 316 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 OR4Q3Q8NH05 313 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 OR4C3Q8NH37 302 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 FLRT3Q9NZU0 649 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 CLEC2DQ9UHP7 191 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 SERTAD3Q9UJW9 196 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 CKMT1AP12532 417 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 FBLP22087 321 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 HOXA6P31267 233 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 STAT5AP42229 794 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 EFNB1P98172 346 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF620Q6ZNG0 422 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 DPYSL5Q9BPU6 564 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF304Q9HCX3 659 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 SEMA5BQ9P283 1151 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1B0GVG6 124 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 SIGLEC6O43699 453 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 SOX30O94993 753 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 APOL3O95236 402 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 CFIP05156 583 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 PIPP12273 146 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 MAKP20794 623 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 GCGRP47871 477 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 ZXDAP98168 799 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 DSG2Q14126 1118 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 ARMCX4Q5H9R4 360 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP40Q5TG30 622 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 HSDL2Q6YN16 418 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 FGF11Q92914 225 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 MVB12AQ96EY5 273 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 G6PC3Q9BUM1 346 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1B0GTQ1 180 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 IFI30P13284 250 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 TDGF1P13385 188 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 GADD45AP24522 165 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 PLK5Q496M5 336 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 AP1ARQ63HQ0 302 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM151BQ8IW70 566 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 SLC34A3Q8N130 599 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 SAP25Q8TEE9 199 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 OSTF1Q92882 214 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 SAMD8Q96LT4 415 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM27Q9HBJ8 222 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 IL20Q9NYY1 176 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 TECTAO75443 2155 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa21.4■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 SLC22A1O15245 554 aa21.4■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 FMO6PO60774 539 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms