RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 OR3A3P47888 321 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SPDYE7PQ495Y7 208 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 OR2T5Q6IEZ7 315 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 NRARPQ7Z6K4 114 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 OR2T29Q8NH02 315 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 NACC2Q96BF6 587 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 RHNO1Q9BSD3 238 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 COPS4Q9BT78 406 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 FKBP14Q9NWM8 211 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 CTSFQ9UBX1 484 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 CTNSO60931 367 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SERPINA1P01009 418 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 ETFAP13804 333 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 ETV5P41161 510 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 ABHD18Q0P651 414 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SAXO2Q658L1 398 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SZRD1Q7Z422 152 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 GLRX5Q86SX6 157 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SLC7A6Q92536 515 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 ELP4Q96EB1 424 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 VNN3Q9NY84 501 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 MEIOCA2RUB1 952 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 DLL1O00548 723 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SSX4O60224 188 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 CSO75390 466 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 KCNK5O95279 499 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 ERP29P30040 261 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 PPP2R1BP30154 601 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 TEKQ02763 1124 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 TP53BP2Q13625 1128 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 C6orf120Q7Z4R8 191 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 PTOV1Q86YD1 416 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 PLCZ1Q86YW0 608 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 PRSS58Q8IYP2 241 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 OR7G2Q8NG99 324 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 NCLNQ969V3 563 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 NEURL3Q96EH8 262 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 CRELD1Q96HD1 420 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 CMKLR1Q99788 373 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 BOLA1Q9Y3E2 137 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 LOXL2Q9Y4K0 774 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 U3KQV3 271 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 CEP250Q9BV73 2442 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 CRATP43155 626 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 LCN10Q6JVE6 187 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 FAM111BQ6SJ93 734 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 OR52N2Q8NGI0 321 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 CEP19Q96LK0 163 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 DMRTB1Q96MA1 342 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 TTYH2Q9BSA4 534 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SERHL2Q9H4I8 314 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 PLSCR3Q9NRY6 295 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 MT-CO3P00414 261 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 ATP1B1P05026 303 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 PPIBP23284 216 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 PRKAG1P54619 331 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 GPAT3Q53EU6 434 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SERPINA11Q86U17 422 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 LAPTM4BQ86VI4 370 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SLC38A6Q8IZM9 456 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 LSMEM1Q8N8F7 131 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 ZFAND1Q8TCF1 268 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 MAL2Q969L2 176 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SEMA3GQ9NS98 782 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 SLC39A1Q9NY26 324 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 AASSQ9UDR5 926 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 CLDN4O14493 209 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 CDK1P06493 297 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 CT62P0C5K7 136 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 CYP4B1P13584 511 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 CDONQ4KMG0 1287 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 ZNF628Q5EBL2 1059 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 HES3Q5TGS1 186 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 P3H2Q8IVL5 708 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 ZZZ3Q8IYH5 903 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 APH1BQ8WW43 257 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms