RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416605.6

HACE1-204, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HACE1, Length 4,729 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-204ENST00000416605 RFLNAQ6ZTI6 216 aa16.02■□□□□ 0.16
HACE1-204ENST00000416605 SLC35F2Q8IXU6 374 aa16.02■□□□□ 0.16
HACE1-204ENST00000416605 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HACE1-204ENST00000416605 MED17Q9NVC6 651 aa16.02■□□□□ 0.16
HACE1-204ENST00000416605 A8MUA0 341 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 KRBOX1C9JBD0 128 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 PRLHRP49683 370 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 BTG1P62324 171 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 RAB11BQ15907 218 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 SFXN4Q6P4A7 337 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 ALKAL2Q6UX46 152 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 CMKLR1Q99788 373 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 NDUFB11Q9NX14 153 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 KCNK2O95069 426 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 GYPBP06028 91 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 30.8
HACE1-204ENST00000416605 KCNJ5P48544 419 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 PFN3P60673 137 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 TLE2Q04725 743 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 PRSS36Q5K4E3 855 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 TMEM185AQ8NFB2 350 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 HMGB4Q8WW32 186 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 ZNF700Q9H0M5 742 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 ZNF226Q9NYT6 803 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 GABRQQ9UN88 632 aa16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 FKTNO75072 461 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 UBL3O95164 117 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 TSPAN12O95859 305 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 C1SP09871 688 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 UGT2B7P16662 529 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 VRK2Q86Y07 508 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 GATSQ8NAP1 163 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 IL17RDQ8NFM7 739 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 BPIFA2Q96DR5 249 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 TMEM184CQ9NVA4 438 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 PGAP2Q9UHJ9 254 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 ZAR1LA6NP61 321 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 HSD11B1P28845 292 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 APOOLQ6UXV4 268 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 SYNPRQ8TBG9 265 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 CD300LFQ8TDQ1 290 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 CHTF18Q8WVB6 975 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 ELP4Q96EB1 424 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 NEURL3Q96EH8 262 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 G6PC3Q9BUM1 346 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 FARS2O95363 451 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 AHSA1O95433 338 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 SGSHP51688 502 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 RAB33AQ14088 237 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 C2orf27AQ580R0 203 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 SYT14P1Q58G82 188 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 MORN1Q5T089 497 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 ZNF852Q6ZMS4 543 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 CCDC190Q86UF4 302 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 OPALINQ96PE5 141 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 ASF1BQ9NVP2 202 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 KCNN3Q9UGI6 736 aa16.01■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 TMEM129A0AVI4 362 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 CSF1P09603 554 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 ADRB3P13945 408 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 CERS1P27544 350 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 GDNFP39905 211 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 NNATQ16517 81 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 BAK1Q16611 211 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 TCTE1Q5JU00 501 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 LEG1Q6P5S2 330 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 PRDM9Q9NQV7 894 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 ASB6Q9NWX5 421 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 V9GY05 133 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 C11orf98E9PRG8 122 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 FGF18O76093 207 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 PSMB10P40306 273 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 TIGD3Q6B0B8 471 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 PTOV1Q86YD1 416 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 ACOT4Q8N9L9 421 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 OR2T4Q8NH00 348 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 CWH43Q9H720 699 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 CLEC4EQ9ULY5 219 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 CHP2O43745 196 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 VNN2O95498 520 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 CSF3P09919 207 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 RBMXP38159 391 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 CD276Q5ZPR3 534 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 ZNF285Q96NJ3 590 aa16■□□□□ 0.15
HACE1-204ENST00000416605 AIFM2Q9BRQ8 373 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms