RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NSA2O95478 260 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HPRP00739 348 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CST1P01037 141 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFNA2P01563 188 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ALBP02768 609 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP1B1P05026 303 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD53P19397 219 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTGER1P34995 402 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPC1P35052 558 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTGS2P35354 604 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FEN1P39748 380 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GCGRP47871 477 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KHKP50053 298 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 XKP51811 444 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCNJ10P78508 379 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRR5P85299 388 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MED21Q13503 144 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NHSL2Q5HYW2 709 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 REEP3Q6NUK4 255 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 P3H2Q8IVL5 708 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LGI4Q8N135 537 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CBR4Q8N4T8 237 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NFKBIDQ8NI38 313 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ELP4Q96EB1 424 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC35G5Q96KT7 338 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RDH12Q96NR8 316 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSF3RQ99062 836 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C3orf14Q9HBI5 128 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKHQ9HCJ1 492 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BCL2L10Q9HD36 194 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 USE1Q9NZ43 259 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANGPT4Q9Y264 503 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 V9GYQ6 96 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1W2PS29 197 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H0YIG0 161 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDE9AO76083 593 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PGM3O95394 542 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MED26O95402 600 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF682O95780 498 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPR75O95800 540 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MT-ND1P03886 318 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COX6A1P12074 109 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPMP14384 443 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MATN1P21941 496 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPP2R1BP30154 601 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SOX18P35713 384 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR1D4P47884 311 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAN2A2P49641 1150 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NUP107P57740 925 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TP53BP2Q13625 1128 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF750Q32MQ0 723 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NDUFAF7Q7L592 441 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARMC8Q8IUR7 673 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR2L13Q8N349 312 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR9A2Q8NGT5 310 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR5K1Q8NHB7 308 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF675Q8TD23 568 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMBIM1Q969X1 311 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAMM41Q96BW9 452 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MVB12AQ96EY5 273 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GIMAP5Q96F15 307 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NRBF2Q96F24 287 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC26A1Q9H2B4 701 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR51I1Q9H343 314 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKRD10Q9NXR5 420 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CBLCQ9ULV8 474 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms