RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409148.1

LRRTM1-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,126 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-202ENST00000409148 A3GALT2U3KPV4 340 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 GKN3PP0CG01 181 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CKMT1AP12532 417 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PRG2P13727 222 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 S1PR1P21453 382 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 HTR2AP28223 471 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 GABRA4P48169 554 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 LIMK1P53667 647 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 RAB40BQ12829 278 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 DEFB133Q30KQ1 61 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ATCAYQ86WG3 371 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 HLA-CQ95604 372 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 HSPA12BQ96MM6 686 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 DACH2Q96NX9 599 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 DGAT2Q96PD7 388 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TGM7Q96PF1 710 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PRSS27Q9BQR3 290 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PDE7BQ9NP56 450 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 EPHA6Q9UF33 1036 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 METTL15A6NJ78 407 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 HRO43593 1189 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MYL12AP19105 171 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SSX1Q16384 188 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 C14orf28Q4W4Y0 310 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 C3orf38Q5JPI3 329 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 OGFOD3Q6PK18 319 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 C11orf74Q86VG3 221 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ANKK1Q8NFD2 765 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 RFKQ969G6 155 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SPACA7Q96KW9 195 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF559Q9BR84 538 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CENPOQ9BU64 300 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 WNT16Q9UBV4 365 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 POU2F3Q9UKI9 436 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 RCVRNP35243 200 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 EMDP50402 254 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 EPHA4P54764 986 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 GFERP55789 205 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PSG6Q00889 435 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PGGHGQ32M88 737 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 OR2T33Q8NG76 320 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 RNFT2Q96EX2 444 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ZDHHC12Q96GR4 267 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CD180Q99467 661 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 RAB33BQ9H082 229 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SIAEQ9HAT2 523 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 HHATLQ9HCP6 504 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 GPR52Q9Y2T5 361 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 THADAQ6YHU6 1953 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 RHPN2P1A8MT19 583 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 TGFBR3LH3BV60 316 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SURF4O15260 269 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PRAMEF2O60811 474 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 HMGN1P05114 100 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 BMP4P12644 408 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 DRD5P21918 477 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 MTNR1AP48039 350 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 RFX3P48380 749 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 MFSD4AQ8N468 514 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SPEM1Q8N4L4 309 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 OR4Q3Q8NH05 313 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 TMEM239Q8WW34 195 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 TMEM27Q9HBJ8 222 aa15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 UNC119BA6NIH7 251 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF749O43361 778 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 FNTBP49356 437 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 HSD17B7P56937 341 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CAMK2BQ13554 666 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF613Q6PF04 617 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ZAR1Q86SH2 424 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 VSTM2LQ96N03 204 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SEC14L4Q9UDX3 406 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 TMEM5Q9Y2B1 443 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 H0YIG0 161 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SSTR4P31391 388 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SOX6P35712 828 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SOX3P41225 446 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms