RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 AKIP1Q9NQ31 210 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 MYO9BQ13459 2157 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAPPC2P0DI81 140 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAPPC2BP0DI82 140 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 PET100P0DJ07 73 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 HTR2AP28223 471 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNJ10P78508 379 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 CHRNEQ04844 493 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 WASH2PQ6VEQ5 465 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 PRRG4Q9BZD6 226 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 PEX11BO96011 259 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 H2BFMP0C1H6 154 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 PRSS3P35030 304 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 PTH2RP49190 550 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC58Q4VC31 144 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 TSTD1Q8NFU3 115 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 MACROD1Q9BQ69 325 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 MS4A8Q9BY19 250 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1B0GVC2 190 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 A6NIN4 97 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 GFYI3L273 518 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 CD1EP15812 388 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 RPS19P39019 145 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 PRKXP51817 358 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 OR5K2Q8NHB8 316 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 WFDC5Q8TCV5 224 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 YIPF6Q96EC8 236 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 CDCA4Q9BXL8 241 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 NIPAL2Q9H841 368 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 FZD3Q9NPG1 666 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 KLRF1Q9NZS2 232 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 POLHQ9Y253 713 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAV18A0A075B6X5 111 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 APBB3O95704 486 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 CHAF1BQ13112 559 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 NUMA1Q14980 2115 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 TSC22D1Q15714 1073 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 HBMQ6B0K9 141 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 LRFN4Q6PJG9 635 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM109AQ8N4B1 249 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 DZANK1Q9NVP4 752 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 KIAA0355O15063 1070 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 ARPC5O15511 151 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 NPPBP16860 134 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 OCLNQ16625 522 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM205BPQ63HN1 556 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 LYSMD1Q96S90 227 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 ACER3Q9NUN7 267 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 OR6C2Q9NZP2 312 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 WASHC1A8K0Z3 465 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 SYT5O00445 386 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC43A1O75387 559 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 FUT1P19526 365 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 PGCP20142 388 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 PCGF3Q3KNV8 242 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 CDNFQ49AH0 187 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 DCST2Q5T1A1 773 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 LIMS2Q7Z4I7 341 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 GKN2Q86XP6 184 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 SDR9C7Q8NEX9 313 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 SFXN1Q9H9B4 322 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 IL21RQ9HBE5 538 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 RLIMQ9NVW2 624 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 GSKIPQ9P0R6 139 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 PLCL2Q9UPR0 1127 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A0G2JMP0 313 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 NPC1O15118 1278 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 DDOSTP39656 456 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 CDC20Q12834 499 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 CDK10Q15131 360 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2-201ENST00000398073 OR4M2Q8NGB6 313 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms